Protein–RNA interactions for Protein: P97347

Rptn, Repetin, mousemouse

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RptnP97347 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RptnP97347 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RptnP97347 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RptnP97347 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RptnP97347 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RptnP97347 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RptnP97347 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RptnP97347 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RptnP97347 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RptnP97347 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RptnP97347 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RptnP97347 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RptnP97347 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RptnP97347 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RptnP97347 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RptnP97347 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RptnP97347 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RptnP97347 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RptnP97347 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RptnP97347 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RptnP97347 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RptnP97347 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RptnP97347 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RptnP97347 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RptnP97347 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RptnP97347 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RptnP97347 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RptnP97347 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RptnP97347 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RptnP97347 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RptnP97347 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RptnP97347 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RptnP97347 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RptnP97347 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RptnP97347 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RptnP97347 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RptnP97347 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RptnP97347 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RptnP97347 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RptnP97347 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RptnP97347 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RptnP97347 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RptnP97347 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RptnP97347 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RptnP97347 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RptnP97347 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RptnP97347 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RptnP97347 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RptnP97347 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RptnP97347 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RptnP97347 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RptnP97347 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RptnP97347 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RptnP97347 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RptnP97347 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RptnP97347 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RptnP97347 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RptnP97347 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RptnP97347 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RptnP97347 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RptnP97347 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RptnP97347 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RptnP97347 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RptnP97347 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RptnP97347 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RptnP97347 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RptnP97347 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RptnP97347 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RptnP97347 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RptnP97347 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RptnP97347 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RptnP97347 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RptnP97347 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RptnP97347 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RptnP97347 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RptnP97347 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RptnP97347 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RptnP97347 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RptnP97347 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RptnP97347 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RptnP97347 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RptnP97347 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RptnP97347 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RptnP97347 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RptnP97347 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RptnP97347 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RptnP97347 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RptnP97347 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RptnP97347 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RptnP97347 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RptnP97347 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RptnP97347 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RptnP97347 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RptnP97347 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RptnP97347 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RptnP97347 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RptnP97347 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RptnP97347 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RptnP97347 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RptnP97347 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms