Protein–RNA interactions for Protein: P70339

Frat1, Proto-oncogene FRAT1, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frat1P70339 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Frat1P70339 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Frat1P70339 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Frat1P70339 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Frat1P70339 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Frat1P70339 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Frat1P70339 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Frat1P70339 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Frat1P70339 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Frat1P70339 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Frat1P70339 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Frat1P70339 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Frat1P70339 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Frat1P70339 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Frat1P70339 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Frat1P70339 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Frat1P70339 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Frat1P70339 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Frat1P70339 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Frat1P70339 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Frat1P70339 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Frat1P70339 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Frat1P70339 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Frat1P70339 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Frat1P70339 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Frat1P70339 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Frat1P70339 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Frat1P70339 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Frat1P70339 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Frat1P70339 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Frat1P70339 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Frat1P70339 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Frat1P70339 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Frat1P70339 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Frat1P70339 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Frat1P70339 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Frat1P70339 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Frat1P70339 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Frat1P70339 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Frat1P70339 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Frat1P70339 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Frat1P70339 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Frat1P70339 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Frat1P70339 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Frat1P70339 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Frat1P70339 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Frat1P70339 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Frat1P70339 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Frat1P70339 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Frat1P70339 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Frat1P70339 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Frat1P70339 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Frat1P70339 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Frat1P70339 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Frat1P70339 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Frat1P70339 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Frat1P70339 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Frat1P70339 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Frat1P70339 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Frat1P70339 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Frat1P70339 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Frat1P70339 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Frat1P70339 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Frat1P70339 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Frat1P70339 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Frat1P70339 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Frat1P70339 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Frat1P70339 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Frat1P70339 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Frat1P70339 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Frat1P70339 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Frat1P70339 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Frat1P70339 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Frat1P70339 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Frat1P70339 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Frat1P70339 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Frat1P70339 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Frat1P70339 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Frat1P70339 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Frat1P70339 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Frat1P70339 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Frat1P70339 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Frat1P70339 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Frat1P70339 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Frat1P70339 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Frat1P70339 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Frat1P70339 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Frat1P70339 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Frat1P70339 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Frat1P70339 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Frat1P70339 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Frat1P70339 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Frat1P70339 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Frat1P70339 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Frat1P70339 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Frat1P70339 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Frat1P70339 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Frat1P70339 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Frat1P70339 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Frat1P70339 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms