Protein–RNA interactions for Protein: P70298

Cux2, Homeobox protein cut-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux2P70298 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
Cux2P70298 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Cux2P70298 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
Cux2P70298 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Cux2P70298 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Cux2P70298 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Cux2P70298 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Cux2P70298 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC33.26■■■□□ 2.92
Cux2P70298 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
Cux2P70298 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC33.26■■■□□ 2.92
Cux2P70298 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
Cux2P70298 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
Cux2P70298 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Cux2P70298 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Cux2P70298 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
Cux2P70298 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Cux2P70298 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
Cux2P70298 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Cux2P70298 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Cux2P70298 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Cux2P70298 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Cux2P70298 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Cux2P70298 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Cux2P70298 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Cux2P70298 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Cux2P70298 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Cux2P70298 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
Cux2P70298 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Cux2P70298 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Cux2P70298 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Cux2P70298 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Cux2P70298 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Cux2P70298 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Cux2P70298 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC33.2■■■□□ 2.91
Cux2P70298 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
Cux2P70298 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
Cux2P70298 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Cux2P70298 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
Cux2P70298 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
Cux2P70298 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Cux2P70298 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
Cux2P70298 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
Cux2P70298 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Cux2P70298 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Cux2P70298 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Cux2P70298 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
Cux2P70298 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Cux2P70298 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Cux2P70298 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Cux2P70298 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC33.18■■■□□ 2.9
Cux2P70298 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Cux2P70298 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Cux2P70298 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Cux2P70298 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Cux2P70298 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
Cux2P70298 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Cux2P70298 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC33.17■■■□□ 2.9
Cux2P70298 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Cux2P70298 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Cux2P70298 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Cux2P70298 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Cux2P70298 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.15■■■□□ 2.9
Cux2P70298 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Cux2P70298 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Cux2P70298 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Cux2P70298 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
Cux2P70298 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Cux2P70298 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Cux2P70298 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
Cux2P70298 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Cux2P70298 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Cux2P70298 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Cux2P70298 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Cux2P70298 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Cux2P70298 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Cux2P70298 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Cux2P70298 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Cux2P70298 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Cux2P70298 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Cux2P70298 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Cux2P70298 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
Cux2P70298 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Cux2P70298 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Cux2P70298 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Cux2P70298 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Cux2P70298 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Cux2P70298 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Cux2P70298 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Cux2P70298 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Cux2P70298 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Cux2P70298 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Cux2P70298 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Cux2P70298 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Cux2P70298 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Cux2P70298 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Cux2P70298 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
Cux2P70298 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Cux2P70298 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
Cux2P70298 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Cux2P70298 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms