Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxd13P70217 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxd13P70217 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxd13P70217 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxd13P70217 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxd13P70217 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxd13P70217 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxd13P70217 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxd13P70217 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxd13P70217 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxd13P70217 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxd13P70217 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxd13P70217 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxd13P70217 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxd13P70217 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxd13P70217 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxd13P70217 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxd13P70217 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxd13P70217 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxd13P70217 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxd13P70217 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxd13P70217 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxd13P70217 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxd13P70217 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxd13P70217 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxd13P70217 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxd13P70217 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxd13P70217 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxd13P70217 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxd13P70217 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxd13P70217 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxd13P70217 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxd13P70217 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hoxd13P70217 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hoxd13P70217 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hoxd13P70217 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hoxd13P70217 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hoxd13P70217 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hoxd13P70217 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Hoxd13P70217 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Hoxd13P70217 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxd13P70217 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxd13P70217 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxd13P70217 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxd13P70217 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Hoxd13P70217 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxd13P70217 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxd13P70217 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxd13P70217 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxd13P70217 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxd13P70217 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxd13P70217 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxd13P70217 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxd13P70217 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Hoxd13P70217 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxd13P70217 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxd13P70217 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxd13P70217 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxd13P70217 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxd13P70217 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxd13P70217 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxd13P70217 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Hoxd13P70217 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxd13P70217 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxd13P70217 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxd13P70217 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxd13P70217 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxd13P70217 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxd13P70217 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Hoxd13P70217 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxd13P70217 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxd13P70217 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxd13P70217 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxd13P70217 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxd13P70217 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxd13P70217 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxd13P70217 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxd13P70217 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxd13P70217 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxd13P70217 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Hoxd13P70217 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hoxd13P70217 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hoxd13P70217 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hoxd13P70217 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hoxd13P70217 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hoxd13P70217 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hoxd13P70217 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hoxd13P70217 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hoxd13P70217 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Hoxd13P70217 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Hoxd13P70217 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Hoxd13P70217 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxd13P70217 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxd13P70217 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxd13P70217 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxd13P70217 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxd13P70217 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxd13P70217 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxd13P70217 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Hoxd13P70217 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms