Protein–RNA interactions for Protein: P61082

Ube2m, NEDD8-conjugating enzyme Ubc12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2mP61082 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Ube2mP61082 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ube2mP61082 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ube2mP61082 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ube2mP61082 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ube2mP61082 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ube2mP61082 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ube2mP61082 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ube2mP61082 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ube2mP61082 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Ube2mP61082 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ube2mP61082 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ube2mP61082 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ube2mP61082 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ube2mP61082 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ube2mP61082 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ube2mP61082 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ube2mP61082 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ube2mP61082 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ube2mP61082 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Ube2mP61082 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ube2mP61082 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ube2mP61082 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ube2mP61082 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ube2mP61082 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ube2mP61082 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ube2mP61082 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ube2mP61082 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ube2mP61082 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ube2mP61082 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Ube2mP61082 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ube2mP61082 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ube2mP61082 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ube2mP61082 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ube2mP61082 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ube2mP61082 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ube2mP61082 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ube2mP61082 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ube2mP61082 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ube2mP61082 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ube2mP61082 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ube2mP61082 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ube2mP61082 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ube2mP61082 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ube2mP61082 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ube2mP61082 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ube2mP61082 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ube2mP61082 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ube2mP61082 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ube2mP61082 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ube2mP61082 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ube2mP61082 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ube2mP61082 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ube2mP61082 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ube2mP61082 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ube2mP61082 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ube2mP61082 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ube2mP61082 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ube2mP61082 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ube2mP61082 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ube2mP61082 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ube2mP61082 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ube2mP61082 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ube2mP61082 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ube2mP61082 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ube2mP61082 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ube2mP61082 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ube2mP61082 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ube2mP61082 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ube2mP61082 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ube2mP61082 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ube2mP61082 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ube2mP61082 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ube2mP61082 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ube2mP61082 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ube2mP61082 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ube2mP61082 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ube2mP61082 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ube2mP61082 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ube2mP61082 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ube2mP61082 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ube2mP61082 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ube2mP61082 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ube2mP61082 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ube2mP61082 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ube2mP61082 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ube2mP61082 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ube2mP61082 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ube2mP61082 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ube2mP61082 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ube2mP61082 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ube2mP61082 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ube2mP61082 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ube2mP61082 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ube2mP61082 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ube2mP61082 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ube2mP61082 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ube2mP61082 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ube2mP61082 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ube2mP61082 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms