Protein–RNA interactions for Protein: P38575

Upk2, Uroplakin-2, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk2P38575 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Upk2P38575 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Upk2P38575 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Upk2P38575 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Upk2P38575 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Upk2P38575 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Upk2P38575 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Upk2P38575 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Upk2P38575 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Upk2P38575 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Upk2P38575 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Upk2P38575 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Upk2P38575 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Upk2P38575 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Upk2P38575 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Upk2P38575 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Upk2P38575 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Upk2P38575 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Upk2P38575 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Upk2P38575 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Upk2P38575 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Upk2P38575 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Upk2P38575 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Upk2P38575 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Upk2P38575 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Upk2P38575 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Upk2P38575 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Upk2P38575 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Upk2P38575 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Upk2P38575 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Upk2P38575 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Upk2P38575 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Upk2P38575 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Upk2P38575 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Upk2P38575 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Upk2P38575 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Upk2P38575 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Upk2P38575 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Upk2P38575 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Upk2P38575 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Upk2P38575 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Upk2P38575 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Upk2P38575 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Upk2P38575 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Upk2P38575 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Upk2P38575 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Upk2P38575 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Upk2P38575 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Upk2P38575 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Upk2P38575 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Upk2P38575 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Upk2P38575 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Upk2P38575 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Upk2P38575 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Upk2P38575 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Upk2P38575 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Upk2P38575 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Upk2P38575 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Upk2P38575 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Upk2P38575 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Upk2P38575 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Upk2P38575 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Upk2P38575 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Upk2P38575 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Upk2P38575 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Upk2P38575 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Upk2P38575 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Upk2P38575 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Upk2P38575 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Upk2P38575 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Upk2P38575 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Upk2P38575 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Upk2P38575 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Upk2P38575 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Upk2P38575 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Upk2P38575 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Upk2P38575 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Upk2P38575 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Upk2P38575 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Upk2P38575 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Upk2P38575 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Upk2P38575 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Upk2P38575 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Upk2P38575 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Upk2P38575 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Upk2P38575 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Upk2P38575 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Upk2P38575 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Upk2P38575 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Upk2P38575 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Upk2P38575 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Upk2P38575 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Upk2P38575 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Upk2P38575 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Upk2P38575 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Upk2P38575 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Upk2P38575 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Upk2P38575 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Upk2P38575 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Upk2P38575 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90 ms