Protein–RNA interactions for Protein: P35242

Sftpa1, Pulmonary surfactant-associated protein A, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sftpa1P35242 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sftpa1P35242 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sftpa1P35242 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sftpa1P35242 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sftpa1P35242 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sftpa1P35242 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sftpa1P35242 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sftpa1P35242 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sftpa1P35242 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sftpa1P35242 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sftpa1P35242 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Sftpa1P35242 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sftpa1P35242 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Sftpa1P35242 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Sftpa1P35242 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Sftpa1P35242 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sftpa1P35242 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sftpa1P35242 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sftpa1P35242 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Sftpa1P35242 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sftpa1P35242 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sftpa1P35242 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sftpa1P35242 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sftpa1P35242 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sftpa1P35242 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Sftpa1P35242 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sftpa1P35242 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sftpa1P35242 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sftpa1P35242 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sftpa1P35242 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sftpa1P35242 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sftpa1P35242 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sftpa1P35242 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sftpa1P35242 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sftpa1P35242 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sftpa1P35242 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sftpa1P35242 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sftpa1P35242 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sftpa1P35242 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sftpa1P35242 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sftpa1P35242 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sftpa1P35242 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sftpa1P35242 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sftpa1P35242 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Sftpa1P35242 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Sftpa1P35242 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Sftpa1P35242 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sftpa1P35242 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sftpa1P35242 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sftpa1P35242 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sftpa1P35242 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sftpa1P35242 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sftpa1P35242 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sftpa1P35242 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sftpa1P35242 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sftpa1P35242 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Sftpa1P35242 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sftpa1P35242 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sftpa1P35242 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sftpa1P35242 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sftpa1P35242 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Sftpa1P35242 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sftpa1P35242 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sftpa1P35242 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sftpa1P35242 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Sftpa1P35242 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sftpa1P35242 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sftpa1P35242 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Sftpa1P35242 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sftpa1P35242 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Sftpa1P35242 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Sftpa1P35242 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sftpa1P35242 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sftpa1P35242 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sftpa1P35242 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sftpa1P35242 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sftpa1P35242 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sftpa1P35242 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sftpa1P35242 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sftpa1P35242 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sftpa1P35242 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sftpa1P35242 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Sftpa1P35242 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sftpa1P35242 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sftpa1P35242 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sftpa1P35242 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sftpa1P35242 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sftpa1P35242 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sftpa1P35242 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sftpa1P35242 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sftpa1P35242 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sftpa1P35242 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sftpa1P35242 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sftpa1P35242 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sftpa1P35242 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sftpa1P35242 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Sftpa1P35242 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sftpa1P35242 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sftpa1P35242 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sftpa1P35242 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms