Protein–RNA interactions for Protein: P29974

Cnga1, cGMP-gated cation channel alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga1P29974 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cnga1P29974 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cnga1P29974 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cnga1P29974 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cnga1P29974 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cnga1P29974 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cnga1P29974 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cnga1P29974 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cnga1P29974 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cnga1P29974 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cnga1P29974 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cnga1P29974 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cnga1P29974 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cnga1P29974 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cnga1P29974 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cnga1P29974 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cnga1P29974 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cnga1P29974 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cnga1P29974 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cnga1P29974 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cnga1P29974 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cnga1P29974 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cnga1P29974 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Cnga1P29974 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cnga1P29974 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cnga1P29974 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cnga1P29974 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cnga1P29974 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cnga1P29974 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Cnga1P29974 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cnga1P29974 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cnga1P29974 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cnga1P29974 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cnga1P29974 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cnga1P29974 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cnga1P29974 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Cnga1P29974 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cnga1P29974 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cnga1P29974 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Cnga1P29974 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cnga1P29974 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cnga1P29974 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cnga1P29974 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cnga1P29974 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cnga1P29974 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cnga1P29974 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cnga1P29974 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Cnga1P29974 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cnga1P29974 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cnga1P29974 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cnga1P29974 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Cnga1P29974 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cnga1P29974 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cnga1P29974 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cnga1P29974 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cnga1P29974 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cnga1P29974 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cnga1P29974 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Cnga1P29974 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cnga1P29974 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cnga1P29974 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cnga1P29974 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cnga1P29974 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cnga1P29974 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cnga1P29974 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cnga1P29974 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cnga1P29974 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Cnga1P29974 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cnga1P29974 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cnga1P29974 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cnga1P29974 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cnga1P29974 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cnga1P29974 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cnga1P29974 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cnga1P29974 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cnga1P29974 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cnga1P29974 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cnga1P29974 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cnga1P29974 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cnga1P29974 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cnga1P29974 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cnga1P29974 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cnga1P29974 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cnga1P29974 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cnga1P29974 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Cnga1P29974 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Cnga1P29974 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cnga1P29974 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Cnga1P29974 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Cnga1P29974 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Cnga1P29974 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Cnga1P29974 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cnga1P29974 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cnga1P29974 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cnga1P29974 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cnga1P29974 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Cnga1P29974 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cnga1P29974 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cnga1P29974 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cnga1P29974 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.1 ms