Protein–RNA interactions for Protein: P29452

Casp1, Caspase-1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp1P29452 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Casp1P29452 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Casp1P29452 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Casp1P29452 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Casp1P29452 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Casp1P29452 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Casp1P29452 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Casp1P29452 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Casp1P29452 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Casp1P29452 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Casp1P29452 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Casp1P29452 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Casp1P29452 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Casp1P29452 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Casp1P29452 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Casp1P29452 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Casp1P29452 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Casp1P29452 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Casp1P29452 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Casp1P29452 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Casp1P29452 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Casp1P29452 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Casp1P29452 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Casp1P29452 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Casp1P29452 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Casp1P29452 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Casp1P29452 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Casp1P29452 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Casp1P29452 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Casp1P29452 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Casp1P29452 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Casp1P29452 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Casp1P29452 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Casp1P29452 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Casp1P29452 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Casp1P29452 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Casp1P29452 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Casp1P29452 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Casp1P29452 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Casp1P29452 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Casp1P29452 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Casp1P29452 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Casp1P29452 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Casp1P29452 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Casp1P29452 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Casp1P29452 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Casp1P29452 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Casp1P29452 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Casp1P29452 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Casp1P29452 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Casp1P29452 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Casp1P29452 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Casp1P29452 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Casp1P29452 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Casp1P29452 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Casp1P29452 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Casp1P29452 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Casp1P29452 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Casp1P29452 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Casp1P29452 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Casp1P29452 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Casp1P29452 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Casp1P29452 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Casp1P29452 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Casp1P29452 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Casp1P29452 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Casp1P29452 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Casp1P29452 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Casp1P29452 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Casp1P29452 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Casp1P29452 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Casp1P29452 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Casp1P29452 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Casp1P29452 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Casp1P29452 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Casp1P29452 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Casp1P29452 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Casp1P29452 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Casp1P29452 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Casp1P29452 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Casp1P29452 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Casp1P29452 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Casp1P29452 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Casp1P29452 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Casp1P29452 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Casp1P29452 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Casp1P29452 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Casp1P29452 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Casp1P29452 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Casp1P29452 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Casp1P29452 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Casp1P29452 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Casp1P29452 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Casp1P29452 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Casp1P29452 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Casp1P29452 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Casp1P29452 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Casp1P29452 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Casp1P29452 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Casp1P29452 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms