Protein–RNA interactions for Protein: P28741

Kif3a, Kinesin-like protein KIF3A, mousemouse

Predictions only

Length 701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif3aP28741 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kif3aP28741 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kif3aP28741 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kif3aP28741 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kif3aP28741 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kif3aP28741 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Kif3aP28741 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Kif3aP28741 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Kif3aP28741 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Kif3aP28741 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Kif3aP28741 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Kif3aP28741 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Kif3aP28741 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Kif3aP28741 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Kif3aP28741 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Kif3aP28741 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Kif3aP28741 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kif3aP28741 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kif3aP28741 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kif3aP28741 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kif3aP28741 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kif3aP28741 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kif3aP28741 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kif3aP28741 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kif3aP28741 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Kif3aP28741 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kif3aP28741 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kif3aP28741 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kif3aP28741 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kif3aP28741 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kif3aP28741 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kif3aP28741 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kif3aP28741 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kif3aP28741 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kif3aP28741 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Kif3aP28741 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kif3aP28741 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kif3aP28741 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kif3aP28741 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kif3aP28741 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kif3aP28741 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kif3aP28741 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kif3aP28741 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kif3aP28741 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Kif3aP28741 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kif3aP28741 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kif3aP28741 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kif3aP28741 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kif3aP28741 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kif3aP28741 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Kif3aP28741 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kif3aP28741 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kif3aP28741 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kif3aP28741 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kif3aP28741 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kif3aP28741 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kif3aP28741 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kif3aP28741 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kif3aP28741 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kif3aP28741 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kif3aP28741 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Kif3aP28741 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Kif3aP28741 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kif3aP28741 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kif3aP28741 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kif3aP28741 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kif3aP28741 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Kif3aP28741 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kif3aP28741 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kif3aP28741 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kif3aP28741 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kif3aP28741 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kif3aP28741 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kif3aP28741 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kif3aP28741 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kif3aP28741 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kif3aP28741 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kif3aP28741 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Kif3aP28741 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kif3aP28741 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kif3aP28741 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kif3aP28741 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kif3aP28741 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kif3aP28741 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kif3aP28741 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kif3aP28741 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kif3aP28741 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kif3aP28741 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kif3aP28741 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kif3aP28741 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Kif3aP28741 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kif3aP28741 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kif3aP28741 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kif3aP28741 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kif3aP28741 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kif3aP28741 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kif3aP28741 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kif3aP28741 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kif3aP28741 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Kif3aP28741 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 148.2 ms