Protein–RNA interactions for Protein: P28076

Psmb9, Proteasome subunit beta type-9, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb9P28076 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Psmb9P28076 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Psmb9P28076 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Psmb9P28076 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Psmb9P28076 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Psmb9P28076 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Psmb9P28076 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Psmb9P28076 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Psmb9P28076 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Psmb9P28076 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Psmb9P28076 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Psmb9P28076 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Psmb9P28076 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Psmb9P28076 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Psmb9P28076 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Psmb9P28076 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Psmb9P28076 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Psmb9P28076 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Psmb9P28076 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Psmb9P28076 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Psmb9P28076 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Psmb9P28076 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Psmb9P28076 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Psmb9P28076 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Psmb9P28076 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Psmb9P28076 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psmb9P28076 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psmb9P28076 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psmb9P28076 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psmb9P28076 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psmb9P28076 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psmb9P28076 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psmb9P28076 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psmb9P28076 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psmb9P28076 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psmb9P28076 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psmb9P28076 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Psmb9P28076 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psmb9P28076 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psmb9P28076 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psmb9P28076 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psmb9P28076 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psmb9P28076 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psmb9P28076 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psmb9P28076 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psmb9P28076 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psmb9P28076 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psmb9P28076 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psmb9P28076 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Psmb9P28076 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Psmb9P28076 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Psmb9P28076 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Psmb9P28076 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Psmb9P28076 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Psmb9P28076 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Psmb9P28076 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Psmb9P28076 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Psmb9P28076 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Psmb9P28076 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Psmb9P28076 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Psmb9P28076 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Psmb9P28076 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Psmb9P28076 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psmb9P28076 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psmb9P28076 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psmb9P28076 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psmb9P28076 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psmb9P28076 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psmb9P28076 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psmb9P28076 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psmb9P28076 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psmb9P28076 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Psmb9P28076 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psmb9P28076 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psmb9P28076 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psmb9P28076 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psmb9P28076 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psmb9P28076 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Psmb9P28076 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psmb9P28076 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psmb9P28076 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psmb9P28076 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psmb9P28076 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Psmb9P28076 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psmb9P28076 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psmb9P28076 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psmb9P28076 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psmb9P28076 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psmb9P28076 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psmb9P28076 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psmb9P28076 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psmb9P28076 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psmb9P28076 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psmb9P28076 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psmb9P28076 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psmb9P28076 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Psmb9P28076 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Psmb9P28076 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Psmb9P28076 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Psmb9P28076 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms