Protein–RNA interactions for Protein: P17433

Spi1, Transcription factor PU.1, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spi1P17433 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spi1P17433 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spi1P17433 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spi1P17433 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spi1P17433 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spi1P17433 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Spi1P17433 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spi1P17433 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spi1P17433 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spi1P17433 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Spi1P17433 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spi1P17433 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spi1P17433 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spi1P17433 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spi1P17433 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spi1P17433 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Spi1P17433 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spi1P17433 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spi1P17433 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spi1P17433 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spi1P17433 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spi1P17433 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spi1P17433 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spi1P17433 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spi1P17433 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Spi1P17433 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Spi1P17433 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spi1P17433 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spi1P17433 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spi1P17433 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spi1P17433 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spi1P17433 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spi1P17433 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spi1P17433 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spi1P17433 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spi1P17433 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Spi1P17433 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spi1P17433 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spi1P17433 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spi1P17433 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Spi1P17433 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spi1P17433 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spi1P17433 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spi1P17433 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spi1P17433 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spi1P17433 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spi1P17433 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spi1P17433 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Spi1P17433 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spi1P17433 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spi1P17433 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spi1P17433 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spi1P17433 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spi1P17433 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spi1P17433 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spi1P17433 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spi1P17433 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Spi1P17433 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Spi1P17433 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spi1P17433 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Spi1P17433 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spi1P17433 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spi1P17433 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Spi1P17433 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spi1P17433 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spi1P17433 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spi1P17433 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spi1P17433 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spi1P17433 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spi1P17433 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Spi1P17433 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spi1P17433 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spi1P17433 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spi1P17433 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spi1P17433 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spi1P17433 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spi1P17433 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spi1P17433 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spi1P17433 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spi1P17433 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Spi1P17433 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spi1P17433 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spi1P17433 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spi1P17433 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spi1P17433 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spi1P17433 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spi1P17433 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spi1P17433 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spi1P17433 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Spi1P17433 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spi1P17433 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spi1P17433 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spi1P17433 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spi1P17433 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spi1P17433 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spi1P17433 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spi1P17433 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spi1P17433 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spi1P17433 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Spi1P17433 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms