Protein–RNA interactions for Protein: P11403

Fgf4, Fibroblast growth factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgf4P11403 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fgf4P11403 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fgf4P11403 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fgf4P11403 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fgf4P11403 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fgf4P11403 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fgf4P11403 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fgf4P11403 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fgf4P11403 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fgf4P11403 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fgf4P11403 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Fgf4P11403 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fgf4P11403 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Fgf4P11403 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fgf4P11403 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fgf4P11403 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fgf4P11403 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fgf4P11403 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Fgf4P11403 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fgf4P11403 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fgf4P11403 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fgf4P11403 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fgf4P11403 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fgf4P11403 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fgf4P11403 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fgf4P11403 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fgf4P11403 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fgf4P11403 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fgf4P11403 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fgf4P11403 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Fgf4P11403 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Fgf4P11403 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Fgf4P11403 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Fgf4P11403 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fgf4P11403 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fgf4P11403 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fgf4P11403 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fgf4P11403 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fgf4P11403 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fgf4P11403 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fgf4P11403 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fgf4P11403 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fgf4P11403 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fgf4P11403 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fgf4P11403 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fgf4P11403 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fgf4P11403 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Fgf4P11403 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fgf4P11403 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fgf4P11403 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fgf4P11403 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fgf4P11403 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fgf4P11403 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fgf4P11403 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fgf4P11403 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fgf4P11403 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Fgf4P11403 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fgf4P11403 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fgf4P11403 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fgf4P11403 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fgf4P11403 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fgf4P11403 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fgf4P11403 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fgf4P11403 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Fgf4P11403 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fgf4P11403 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fgf4P11403 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fgf4P11403 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fgf4P11403 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fgf4P11403 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fgf4P11403 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fgf4P11403 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fgf4P11403 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fgf4P11403 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fgf4P11403 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fgf4P11403 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fgf4P11403 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fgf4P11403 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fgf4P11403 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fgf4P11403 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fgf4P11403 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fgf4P11403 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Fgf4P11403 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fgf4P11403 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fgf4P11403 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fgf4P11403 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fgf4P11403 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fgf4P11403 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fgf4P11403 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fgf4P11403 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Fgf4P11403 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Fgf4P11403 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fgf4P11403 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fgf4P11403 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fgf4P11403 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fgf4P11403 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fgf4P11403 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Fgf4P11403 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Fgf4P11403 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Fgf4P11403 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms