Protein–RNA interactions for Protein: P0C1T1

Hoxb2, Homeobox protein Hox-B2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb2P0C1T1 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxb2P0C1T1 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxb2P0C1T1 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxb2P0C1T1 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxb2P0C1T1 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxb2P0C1T1 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxb2P0C1T1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Hoxb2P0C1T1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxb2P0C1T1 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxb2P0C1T1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxb2P0C1T1 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxb2P0C1T1 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxb2P0C1T1 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxb2P0C1T1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxb2P0C1T1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxb2P0C1T1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxb2P0C1T1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxb2P0C1T1 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxb2P0C1T1 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxb2P0C1T1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxb2P0C1T1 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxb2P0C1T1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Hoxb2P0C1T1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hoxb2P0C1T1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hoxb2P0C1T1 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Hoxb2P0C1T1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxb2P0C1T1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxb2P0C1T1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxb2P0C1T1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxb2P0C1T1 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxb2P0C1T1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxb2P0C1T1 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxb2P0C1T1 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxb2P0C1T1 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Hoxb2P0C1T1 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxb2P0C1T1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxb2P0C1T1 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxb2P0C1T1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxb2P0C1T1 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxb2P0C1T1 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxb2P0C1T1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxb2P0C1T1 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxb2P0C1T1 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxb2P0C1T1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxb2P0C1T1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Hoxb2P0C1T1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxb2P0C1T1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxb2P0C1T1 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxb2P0C1T1 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxb2P0C1T1 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxb2P0C1T1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxb2P0C1T1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxb2P0C1T1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Hoxb2P0C1T1 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxb2P0C1T1 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxb2P0C1T1 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxb2P0C1T1 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxb2P0C1T1 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxb2P0C1T1 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxb2P0C1T1 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxb2P0C1T1 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxb2P0C1T1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxb2P0C1T1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Hoxb2P0C1T1 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxb2P0C1T1 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxb2P0C1T1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxb2P0C1T1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxb2P0C1T1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxb2P0C1T1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Hoxb2P0C1T1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxb2P0C1T1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxb2P0C1T1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxb2P0C1T1 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxb2P0C1T1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxb2P0C1T1 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxb2P0C1T1 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxb2P0C1T1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Hoxb2P0C1T1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Hoxb2P0C1T1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxb2P0C1T1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxb2P0C1T1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxb2P0C1T1 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxb2P0C1T1 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxb2P0C1T1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxb2P0C1T1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxb2P0C1T1 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxb2P0C1T1 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxb2P0C1T1 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxb2P0C1T1 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxb2P0C1T1 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxb2P0C1T1 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Hoxb2P0C1T1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxb2P0C1T1 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxb2P0C1T1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxb2P0C1T1 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxb2P0C1T1 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxb2P0C1T1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxb2P0C1T1 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxb2P0C1T1 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Hoxb2P0C1T1 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms