Protein–RNA interactions for Protein: O88343

Slc4a4, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc4a4O88343 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slc4a4O88343 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slc4a4O88343 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Slc4a4O88343 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc4a4O88343 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc4a4O88343 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc4a4O88343 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc4a4O88343 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc4a4O88343 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc4a4O88343 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc4a4O88343 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc4a4O88343 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Slc4a4O88343 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slc4a4O88343 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slc4a4O88343 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slc4a4O88343 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slc4a4O88343 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Slc4a4O88343 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slc4a4O88343 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slc4a4O88343 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Slc4a4O88343 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Slc4a4O88343 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc4a4O88343 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc4a4O88343 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc4a4O88343 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Slc4a4O88343 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc4a4O88343 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc4a4O88343 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc4a4O88343 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc4a4O88343 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc4a4O88343 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc4a4O88343 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc4a4O88343 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc4a4O88343 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc4a4O88343 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc4a4O88343 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc4a4O88343 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc4a4O88343 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc4a4O88343 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc4a4O88343 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Slc4a4O88343 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc4a4O88343 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc4a4O88343 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc4a4O88343 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc4a4O88343 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc4a4O88343 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc4a4O88343 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc4a4O88343 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc4a4O88343 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc4a4O88343 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc4a4O88343 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Slc4a4O88343 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc4a4O88343 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc4a4O88343 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc4a4O88343 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc4a4O88343 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc4a4O88343 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc4a4O88343 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc4a4O88343 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc4a4O88343 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc4a4O88343 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Slc4a4O88343 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc4a4O88343 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc4a4O88343 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc4a4O88343 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc4a4O88343 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc4a4O88343 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Slc4a4O88343 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc4a4O88343 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc4a4O88343 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc4a4O88343 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc4a4O88343 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc4a4O88343 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc4a4O88343 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc4a4O88343 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc4a4O88343 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Slc4a4O88343 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Slc4a4O88343 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Slc4a4O88343 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Slc4a4O88343 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slc4a4O88343 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slc4a4O88343 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slc4a4O88343 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Slc4a4O88343 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc4a4O88343 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc4a4O88343 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc4a4O88343 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc4a4O88343 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc4a4O88343 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc4a4O88343 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc4a4O88343 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc4a4O88343 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc4a4O88343 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc4a4O88343 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Slc4a4O88343 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc4a4O88343 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc4a4O88343 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc4a4O88343 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc4a4O88343 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Slc4a4O88343 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.3 ms