Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Vamp4O70480 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Vamp4O70480 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Vamp4O70480 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Vamp4O70480 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Vamp4O70480 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Vamp4O70480 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Vamp4O70480 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Vamp4O70480 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Vamp4O70480 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Vamp4O70480 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Vamp4O70480 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Vamp4O70480 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Vamp4O70480 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Vamp4O70480 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Vamp4O70480 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Vamp4O70480 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Vamp4O70480 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Vamp4O70480 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Vamp4O70480 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Vamp4O70480 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Vamp4O70480 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Vamp4O70480 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Vamp4O70480 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Vamp4O70480 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Vamp4O70480 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Vamp4O70480 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Vamp4O70480 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Vamp4O70480 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Vamp4O70480 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Vamp4O70480 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Vamp4O70480 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Vamp4O70480 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Vamp4O70480 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Vamp4O70480 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Vamp4O70480 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Vamp4O70480 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Vamp4O70480 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Vamp4O70480 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Vamp4O70480 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Vamp4O70480 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Vamp4O70480 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Vamp4O70480 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Vamp4O70480 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Vamp4O70480 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Vamp4O70480 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Vamp4O70480 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Vamp4O70480 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Vamp4O70480 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Vamp4O70480 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Vamp4O70480 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Vamp4O70480 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Vamp4O70480 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Vamp4O70480 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Vamp4O70480 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Vamp4O70480 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Vamp4O70480 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Vamp4O70480 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Vamp4O70480 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Vamp4O70480 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Vamp4O70480 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Vamp4O70480 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Vamp4O70480 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Vamp4O70480 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Vamp4O70480 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Vamp4O70480 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Vamp4O70480 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Vamp4O70480 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Vamp4O70480 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Vamp4O70480 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Vamp4O70480 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Vamp4O70480 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Vamp4O70480 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Vamp4O70480 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Vamp4O70480 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Vamp4O70480 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Vamp4O70480 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Vamp4O70480 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Vamp4O70480 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Vamp4O70480 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Vamp4O70480 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Vamp4O70480 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Vamp4O70480 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Vamp4O70480 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Vamp4O70480 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Vamp4O70480 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Vamp4O70480 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Vamp4O70480 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Vamp4O70480 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Vamp4O70480 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Vamp4O70480 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Vamp4O70480 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Vamp4O70480 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Vamp4O70480 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Vamp4O70480 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Vamp4O70480 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Vamp4O70480 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Vamp4O70480 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Vamp4O70480 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Vamp4O70480 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms