Protein–RNA interactions for Protein: J3QNX5

Shisa8, Cysteine-knot AMPAR-modulating protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa8J3QNX5 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Shisa8J3QNX5 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Shisa8J3QNX5 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Shisa8J3QNX5 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Shisa8J3QNX5 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Shisa8J3QNX5 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Shisa8J3QNX5 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Shisa8J3QNX5 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Shisa8J3QNX5 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Shisa8J3QNX5 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Shisa8J3QNX5 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Shisa8J3QNX5 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Shisa8J3QNX5 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Shisa8J3QNX5 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Shisa8J3QNX5 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Shisa8J3QNX5 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Shisa8J3QNX5 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Shisa8J3QNX5 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Shisa8J3QNX5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Shisa8J3QNX5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Shisa8J3QNX5 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Shisa8J3QNX5 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Shisa8J3QNX5 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Shisa8J3QNX5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Shisa8J3QNX5 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Shisa8J3QNX5 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Shisa8J3QNX5 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Shisa8J3QNX5 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Shisa8J3QNX5 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Shisa8J3QNX5 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Shisa8J3QNX5 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Shisa8J3QNX5 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Shisa8J3QNX5 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Shisa8J3QNX5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Shisa8J3QNX5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Shisa8J3QNX5 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Shisa8J3QNX5 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Shisa8J3QNX5 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Shisa8J3QNX5 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Shisa8J3QNX5 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Shisa8J3QNX5 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Shisa8J3QNX5 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Shisa8J3QNX5 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Shisa8J3QNX5 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Shisa8J3QNX5 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Shisa8J3QNX5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Shisa8J3QNX5 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Shisa8J3QNX5 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Shisa8J3QNX5 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Shisa8J3QNX5 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Shisa8J3QNX5 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Shisa8J3QNX5 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Shisa8J3QNX5 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Shisa8J3QNX5 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Shisa8J3QNX5 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Shisa8J3QNX5 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Shisa8J3QNX5 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Shisa8J3QNX5 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Shisa8J3QNX5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Shisa8J3QNX5 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Shisa8J3QNX5 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Shisa8J3QNX5 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Shisa8J3QNX5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Shisa8J3QNX5 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Shisa8J3QNX5 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Shisa8J3QNX5 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Shisa8J3QNX5 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Shisa8J3QNX5 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Shisa8J3QNX5 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Shisa8J3QNX5 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Shisa8J3QNX5 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Shisa8J3QNX5 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Shisa8J3QNX5 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Shisa8J3QNX5 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Shisa8J3QNX5 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Shisa8J3QNX5 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Shisa8J3QNX5 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Shisa8J3QNX5 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Shisa8J3QNX5 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Shisa8J3QNX5 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Shisa8J3QNX5 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Shisa8J3QNX5 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Shisa8J3QNX5 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Shisa8J3QNX5 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Shisa8J3QNX5 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Shisa8J3QNX5 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Shisa8J3QNX5 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Shisa8J3QNX5 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Shisa8J3QNX5 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Shisa8J3QNX5 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Shisa8J3QNX5 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Shisa8J3QNX5 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Shisa8J3QNX5 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Shisa8J3QNX5 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Shisa8J3QNX5 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Shisa8J3QNX5 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Shisa8J3QNX5 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Shisa8J3QNX5 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Shisa8J3QNX5 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Shisa8J3QNX5 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.9 ms