Protein–RNA interactions for Protein: J3QK38

Gm21244, MCG116195, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Gm21244J3QK38 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm21244J3QK38 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Gm21244J3QK38 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm21244J3QK38 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Gm21244J3QK38 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Gm21244J3QK38 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm21244J3QK38 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm21244J3QK38 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm21244J3QK38 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Gm21244J3QK38 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm21244J3QK38 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm21244J3QK38 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Gm21244J3QK38 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm21244J3QK38 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Gm21244J3QK38 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm21244J3QK38 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm21244J3QK38 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm21244J3QK38 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm21244J3QK38 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Gm21244J3QK38 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm21244J3QK38 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm21244J3QK38 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Gm21244J3QK38 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Gm21244J3QK38 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm21244J3QK38 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Gm21244J3QK38 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Gm21244J3QK38 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Gm21244J3QK38 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
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Gm21244J3QK38 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21244J3QK38 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21244J3QK38 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21244J3QK38 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21244J3QK38 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21244J3QK38 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21244J3QK38 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21244J3QK38 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Gm21244J3QK38 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Gm21244J3QK38 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Gm21244J3QK38 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm21244J3QK38 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm21244J3QK38 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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Gm21244J3QK38 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm21244J3QK38 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm21244J3QK38 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm21244J3QK38 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Gm21244J3QK38 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm21244J3QK38 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm21244J3QK38 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Gm21244J3QK38 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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