Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn34c3J3QJW5 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn34c3J3QJW5 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Cldn34c3J3QJW5 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn34c3J3QJW5 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn34c3J3QJW5 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn34c3J3QJW5 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn34c3J3QJW5 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn34c3J3QJW5 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn34c3J3QJW5 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn34c3J3QJW5 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn34c3J3QJW5 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn34c3J3QJW5 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn34c3J3QJW5 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn34c3J3QJW5 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn34c3J3QJW5 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn34c3J3QJW5 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn34c3J3QJW5 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Cldn34c3J3QJW5 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cldn34c3J3QJW5 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cldn34c3J3QJW5 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Cldn34c3J3QJW5 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn34c3J3QJW5 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn34c3J3QJW5 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn34c3J3QJW5 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn34c3J3QJW5 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn34c3J3QJW5 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn34c3J3QJW5 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn34c3J3QJW5 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn34c3J3QJW5 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn34c3J3QJW5 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn34c3J3QJW5 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Cldn34c3J3QJW5 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn34c3J3QJW5 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn34c3J3QJW5 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn34c3J3QJW5 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn34c3J3QJW5 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn34c3J3QJW5 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn34c3J3QJW5 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn34c3J3QJW5 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn34c3J3QJW5 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn34c3J3QJW5 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn34c3J3QJW5 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn34c3J3QJW5 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn34c3J3QJW5 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn34c3J3QJW5 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn34c3J3QJW5 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn34c3J3QJW5 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn34c3J3QJW5 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn34c3J3QJW5 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn34c3J3QJW5 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn34c3J3QJW5 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn34c3J3QJW5 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn34c3J3QJW5 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn34c3J3QJW5 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn34c3J3QJW5 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn34c3J3QJW5 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn34c3J3QJW5 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn34c3J3QJW5 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn34c3J3QJW5 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn34c3J3QJW5 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn34c3J3QJW5 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn34c3J3QJW5 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn34c3J3QJW5 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn34c3J3QJW5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn34c3J3QJW5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn34c3J3QJW5 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn34c3J3QJW5 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn34c3J3QJW5 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn34c3J3QJW5 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn34c3J3QJW5 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn34c3J3QJW5 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn34c3J3QJW5 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn34c3J3QJW5 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn34c3J3QJW5 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn34c3J3QJW5 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn34c3J3QJW5 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn34c3J3QJW5 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn34c3J3QJW5 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn34c3J3QJW5 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn34c3J3QJW5 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn34c3J3QJW5 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn34c3J3QJW5 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn34c3J3QJW5 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn34c3J3QJW5 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn34c3J3QJW5 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn34c3J3QJW5 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn34c3J3QJW5 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn34c3J3QJW5 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn34c3J3QJW5 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn34c3J3QJW5 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn34c3J3QJW5 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn34c3J3QJW5 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn34c3J3QJW5 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn34c3J3QJW5 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cldn34c3J3QJW5 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn34c3J3QJW5 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn34c3J3QJW5 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn34c3J3QJW5 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cldn34c3J3QJW5 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
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