Protein–RNA interactions for Protein: F8VPX6

Speer4a, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4aF8VPX6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Speer4aF8VPX6 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Speer4aF8VPX6 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Speer4aF8VPX6 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Speer4aF8VPX6 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Speer4aF8VPX6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Speer4aF8VPX6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Speer4aF8VPX6 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Speer4aF8VPX6 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Speer4aF8VPX6 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Speer4aF8VPX6 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Speer4aF8VPX6 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Speer4aF8VPX6 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Speer4aF8VPX6 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Speer4aF8VPX6 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Speer4aF8VPX6 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Speer4aF8VPX6 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Speer4aF8VPX6 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Speer4aF8VPX6 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Speer4aF8VPX6 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Speer4aF8VPX6 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Speer4aF8VPX6 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Speer4aF8VPX6 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Speer4aF8VPX6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Speer4aF8VPX6 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Speer4aF8VPX6 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Speer4aF8VPX6 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Speer4aF8VPX6 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Speer4aF8VPX6 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Speer4aF8VPX6 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Speer4aF8VPX6 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Speer4aF8VPX6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Speer4aF8VPX6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Speer4aF8VPX6 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Speer4aF8VPX6 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Speer4aF8VPX6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Speer4aF8VPX6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Speer4aF8VPX6 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Speer4aF8VPX6 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Speer4aF8VPX6 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Speer4aF8VPX6 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Speer4aF8VPX6 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Speer4aF8VPX6 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Speer4aF8VPX6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Speer4aF8VPX6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Speer4aF8VPX6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Speer4aF8VPX6 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Speer4aF8VPX6 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Speer4aF8VPX6 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Speer4aF8VPX6 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Speer4aF8VPX6 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Speer4aF8VPX6 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Speer4aF8VPX6 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Speer4aF8VPX6 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Speer4aF8VPX6 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Speer4aF8VPX6 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Speer4aF8VPX6 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Speer4aF8VPX6 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Speer4aF8VPX6 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Speer4aF8VPX6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Speer4aF8VPX6 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Speer4aF8VPX6 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Speer4aF8VPX6 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Speer4aF8VPX6 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Speer4aF8VPX6 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Speer4aF8VPX6 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Speer4aF8VPX6 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Speer4aF8VPX6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Speer4aF8VPX6 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Speer4aF8VPX6 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Speer4aF8VPX6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Speer4aF8VPX6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Speer4aF8VPX6 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Speer4aF8VPX6 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Speer4aF8VPX6 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Speer4aF8VPX6 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Speer4aF8VPX6 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Speer4aF8VPX6 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Speer4aF8VPX6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Speer4aF8VPX6 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Speer4aF8VPX6 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Speer4aF8VPX6 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Speer4aF8VPX6 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Speer4aF8VPX6 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Speer4aF8VPX6 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Speer4aF8VPX6 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Speer4aF8VPX6 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Speer4aF8VPX6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Speer4aF8VPX6 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Speer4aF8VPX6 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Speer4aF8VPX6 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Speer4aF8VPX6 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Speer4aF8VPX6 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Speer4aF8VPX6 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Speer4aF8VPX6 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Speer4aF8VPX6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Speer4aF8VPX6 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Speer4aF8VPX6 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Speer4aF8VPX6 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Speer4aF8VPX6 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms