Protein–RNA interactions for Protein: F2Z3Y9

2610001J05Rik, RIKEN cDNA 2610001J05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610001J05RikF2Z3Y9 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
2610001J05RikF2Z3Y9 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
2610001J05RikF2Z3Y9 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
2610001J05RikF2Z3Y9 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
2610001J05RikF2Z3Y9 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
2610001J05RikF2Z3Y9 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
2610001J05RikF2Z3Y9 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
2610001J05RikF2Z3Y9 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
2610001J05RikF2Z3Y9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
2610001J05RikF2Z3Y9 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
2610001J05RikF2Z3Y9 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
2610001J05RikF2Z3Y9 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
2610001J05RikF2Z3Y9 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
2610001J05RikF2Z3Y9 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
2610001J05RikF2Z3Y9 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
2610001J05RikF2Z3Y9 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
2610001J05RikF2Z3Y9 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
2610001J05RikF2Z3Y9 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
2610001J05RikF2Z3Y9 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
2610001J05RikF2Z3Y9 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
2610001J05RikF2Z3Y9 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
2610001J05RikF2Z3Y9 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
2610001J05RikF2Z3Y9 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
2610001J05RikF2Z3Y9 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
2610001J05RikF2Z3Y9 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
2610001J05RikF2Z3Y9 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
2610001J05RikF2Z3Y9 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
2610001J05RikF2Z3Y9 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
2610001J05RikF2Z3Y9 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
2610001J05RikF2Z3Y9 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
2610001J05RikF2Z3Y9 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
2610001J05RikF2Z3Y9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
2610001J05RikF2Z3Y9 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
2610001J05RikF2Z3Y9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
2610001J05RikF2Z3Y9 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
2610001J05RikF2Z3Y9 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
2610001J05RikF2Z3Y9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
2610001J05RikF2Z3Y9 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
2610001J05RikF2Z3Y9 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
2610001J05RikF2Z3Y9 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
2610001J05RikF2Z3Y9 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
2610001J05RikF2Z3Y9 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
2610001J05RikF2Z3Y9 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
2610001J05RikF2Z3Y9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
2610001J05RikF2Z3Y9 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
2610001J05RikF2Z3Y9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
2610001J05RikF2Z3Y9 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
2610001J05RikF2Z3Y9 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
2610001J05RikF2Z3Y9 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
2610001J05RikF2Z3Y9 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
2610001J05RikF2Z3Y9 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
2610001J05RikF2Z3Y9 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
2610001J05RikF2Z3Y9 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
2610001J05RikF2Z3Y9 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
2610001J05RikF2Z3Y9 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
2610001J05RikF2Z3Y9 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
2610001J05RikF2Z3Y9 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
2610001J05RikF2Z3Y9 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
2610001J05RikF2Z3Y9 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
2610001J05RikF2Z3Y9 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
2610001J05RikF2Z3Y9 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
2610001J05RikF2Z3Y9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
2610001J05RikF2Z3Y9 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
2610001J05RikF2Z3Y9 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
2610001J05RikF2Z3Y9 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
2610001J05RikF2Z3Y9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
2610001J05RikF2Z3Y9 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
2610001J05RikF2Z3Y9 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
2610001J05RikF2Z3Y9 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
2610001J05RikF2Z3Y9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
2610001J05RikF2Z3Y9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
2610001J05RikF2Z3Y9 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
2610001J05RikF2Z3Y9 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
2610001J05RikF2Z3Y9 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
2610001J05RikF2Z3Y9 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
2610001J05RikF2Z3Y9 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
2610001J05RikF2Z3Y9 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
2610001J05RikF2Z3Y9 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
2610001J05RikF2Z3Y9 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
2610001J05RikF2Z3Y9 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
2610001J05RikF2Z3Y9 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
2610001J05RikF2Z3Y9 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
2610001J05RikF2Z3Y9 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
2610001J05RikF2Z3Y9 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
2610001J05RikF2Z3Y9 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
2610001J05RikF2Z3Y9 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
2610001J05RikF2Z3Y9 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
2610001J05RikF2Z3Y9 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
2610001J05RikF2Z3Y9 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
2610001J05RikF2Z3Y9 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
2610001J05RikF2Z3Y9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
2610001J05RikF2Z3Y9 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
2610001J05RikF2Z3Y9 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
2610001J05RikF2Z3Y9 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
2610001J05RikF2Z3Y9 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
2610001J05RikF2Z3Y9 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
2610001J05RikF2Z3Y9 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
2610001J05RikF2Z3Y9 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms