Protein–RNA interactions for Protein: E9Q528

Gm17175, Predicted gene 17175, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17175E9Q528 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm17175E9Q528 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm17175E9Q528 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm17175E9Q528 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm17175E9Q528 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm17175E9Q528 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm17175E9Q528 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm17175E9Q528 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm17175E9Q528 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm17175E9Q528 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm17175E9Q528 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm17175E9Q528 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm17175E9Q528 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm17175E9Q528 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm17175E9Q528 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm17175E9Q528 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm17175E9Q528 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm17175E9Q528 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm17175E9Q528 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm17175E9Q528 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm17175E9Q528 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm17175E9Q528 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm17175E9Q528 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm17175E9Q528 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm17175E9Q528 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm17175E9Q528 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm17175E9Q528 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm17175E9Q528 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm17175E9Q528 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm17175E9Q528 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm17175E9Q528 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm17175E9Q528 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm17175E9Q528 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm17175E9Q528 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm17175E9Q528 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm17175E9Q528 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm17175E9Q528 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm17175E9Q528 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm17175E9Q528 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm17175E9Q528 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm17175E9Q528 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm17175E9Q528 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm17175E9Q528 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm17175E9Q528 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm17175E9Q528 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm17175E9Q528 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm17175E9Q528 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm17175E9Q528 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm17175E9Q528 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm17175E9Q528 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm17175E9Q528 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm17175E9Q528 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm17175E9Q528 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm17175E9Q528 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm17175E9Q528 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm17175E9Q528 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm17175E9Q528 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm17175E9Q528 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm17175E9Q528 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm17175E9Q528 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm17175E9Q528 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm17175E9Q528 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm17175E9Q528 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm17175E9Q528 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm17175E9Q528 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm17175E9Q528 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm17175E9Q528 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm17175E9Q528 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm17175E9Q528 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm17175E9Q528 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm17175E9Q528 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm17175E9Q528 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm17175E9Q528 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm17175E9Q528 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm17175E9Q528 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm17175E9Q528 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm17175E9Q528 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm17175E9Q528 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm17175E9Q528 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm17175E9Q528 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm17175E9Q528 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm17175E9Q528 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm17175E9Q528 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm17175E9Q528 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm17175E9Q528 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm17175E9Q528 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm17175E9Q528 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm17175E9Q528 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm17175E9Q528 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm17175E9Q528 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm17175E9Q528 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm17175E9Q528 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm17175E9Q528 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm17175E9Q528 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm17175E9Q528 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm17175E9Q528 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm17175E9Q528 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm17175E9Q528 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm17175E9Q528 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm17175E9Q528 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms