Protein–RNA interactions for Protein: D3Z5T1

Ccdc78, Coiled-coil domain-containing protein 78, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc78D3Z5T1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc78D3Z5T1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc78D3Z5T1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc78D3Z5T1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc78D3Z5T1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc78D3Z5T1 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc78D3Z5T1 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc78D3Z5T1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc78D3Z5T1 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc78D3Z5T1 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc78D3Z5T1 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc78D3Z5T1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc78D3Z5T1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ccdc78D3Z5T1 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc78D3Z5T1 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc78D3Z5T1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc78D3Z5T1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc78D3Z5T1 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc78D3Z5T1 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc78D3Z5T1 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc78D3Z5T1 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc78D3Z5T1 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc78D3Z5T1 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc78D3Z5T1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc78D3Z5T1 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc78D3Z5T1 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ccdc78D3Z5T1 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc78D3Z5T1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc78D3Z5T1 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc78D3Z5T1 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc78D3Z5T1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc78D3Z5T1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc78D3Z5T1 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc78D3Z5T1 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ccdc78D3Z5T1 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc78D3Z5T1 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc78D3Z5T1 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc78D3Z5T1 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc78D3Z5T1 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc78D3Z5T1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc78D3Z5T1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc78D3Z5T1 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc78D3Z5T1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ccdc78D3Z5T1 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc78D3Z5T1 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc78D3Z5T1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc78D3Z5T1 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc78D3Z5T1 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc78D3Z5T1 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc78D3Z5T1 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc78D3Z5T1 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc78D3Z5T1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ccdc78D3Z5T1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc78D3Z5T1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc78D3Z5T1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc78D3Z5T1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc78D3Z5T1 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc78D3Z5T1 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ccdc78D3Z5T1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc78D3Z5T1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc78D3Z5T1 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc78D3Z5T1 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc78D3Z5T1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ccdc78D3Z5T1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc78D3Z5T1 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc78D3Z5T1 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc78D3Z5T1 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc78D3Z5T1 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ccdc78D3Z5T1 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ccdc78D3Z5T1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc78D3Z5T1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc78D3Z5T1 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc78D3Z5T1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc78D3Z5T1 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc78D3Z5T1 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc78D3Z5T1 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc78D3Z5T1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc78D3Z5T1 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc78D3Z5T1 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc78D3Z5T1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc78D3Z5T1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc78D3Z5T1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc78D3Z5T1 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc78D3Z5T1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc78D3Z5T1 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc78D3Z5T1 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc78D3Z5T1 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc78D3Z5T1 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc78D3Z5T1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc78D3Z5T1 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc78D3Z5T1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc78D3Z5T1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc78D3Z5T1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc78D3Z5T1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc78D3Z5T1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc78D3Z5T1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc78D3Z5T1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc78D3Z5T1 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc78D3Z5T1 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc78D3Z5T1 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms