Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Apba1B2RUJ5 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Apba1B2RUJ5 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Apba1B2RUJ5 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Apba1B2RUJ5 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Apba1B2RUJ5 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Apba1B2RUJ5 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Apba1B2RUJ5 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Apba1B2RUJ5 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Apba1B2RUJ5 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Apba1B2RUJ5 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Apba1B2RUJ5 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Apba1B2RUJ5 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Apba1B2RUJ5 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Apba1B2RUJ5 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Apba1B2RUJ5 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Apba1B2RUJ5 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Apba1B2RUJ5 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Apba1B2RUJ5 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Apba1B2RUJ5 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Apba1B2RUJ5 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Apba1B2RUJ5 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Apba1B2RUJ5 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Apba1B2RUJ5 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Apba1B2RUJ5 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Apba1B2RUJ5 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Apba1B2RUJ5 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Apba1B2RUJ5 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Apba1B2RUJ5 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Apba1B2RUJ5 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Apba1B2RUJ5 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Apba1B2RUJ5 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Apba1B2RUJ5 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Apba1B2RUJ5 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Apba1B2RUJ5 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Apba1B2RUJ5 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Apba1B2RUJ5 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Apba1B2RUJ5 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Apba1B2RUJ5 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Apba1B2RUJ5 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Apba1B2RUJ5 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Apba1B2RUJ5 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Apba1B2RUJ5 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Apba1B2RUJ5 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Apba1B2RUJ5 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Apba1B2RUJ5 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Apba1B2RUJ5 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Apba1B2RUJ5 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Apba1B2RUJ5 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Apba1B2RUJ5 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Apba1B2RUJ5 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Apba1B2RUJ5 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Apba1B2RUJ5 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Apba1B2RUJ5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Apba1B2RUJ5 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Apba1B2RUJ5 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Apba1B2RUJ5 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Apba1B2RUJ5 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Apba1B2RUJ5 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Apba1B2RUJ5 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Apba1B2RUJ5 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Apba1B2RUJ5 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Apba1B2RUJ5 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Apba1B2RUJ5 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Apba1B2RUJ5 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Apba1B2RUJ5 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Apba1B2RUJ5 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Apba1B2RUJ5 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Apba1B2RUJ5 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Apba1B2RUJ5 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Apba1B2RUJ5 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Apba1B2RUJ5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Apba1B2RUJ5 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Apba1B2RUJ5 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Apba1B2RUJ5 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Apba1B2RUJ5 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Apba1B2RUJ5 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Apba1B2RUJ5 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Apba1B2RUJ5 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Apba1B2RUJ5 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Apba1B2RUJ5 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Apba1B2RUJ5 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Apba1B2RUJ5 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Apba1B2RUJ5 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Apba1B2RUJ5 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Apba1B2RUJ5 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Apba1B2RUJ5 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Apba1B2RUJ5 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Apba1B2RUJ5 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Apba1B2RUJ5 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Apba1B2RUJ5 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Apba1B2RUJ5 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Apba1B2RUJ5 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Apba1B2RUJ5 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Apba1B2RUJ5 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Apba1B2RUJ5 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Apba1B2RUJ5 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Apba1B2RUJ5 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Apba1B2RUJ5 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Apba1B2RUJ5 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms