Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PtprbB2RU80 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PtprbB2RU80 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PtprbB2RU80 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PtprbB2RU80 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PtprbB2RU80 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PtprbB2RU80 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PtprbB2RU80 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PtprbB2RU80 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PtprbB2RU80 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PtprbB2RU80 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PtprbB2RU80 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PtprbB2RU80 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PtprbB2RU80 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
PtprbB2RU80 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PtprbB2RU80 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PtprbB2RU80 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PtprbB2RU80 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PtprbB2RU80 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PtprbB2RU80 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PtprbB2RU80 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PtprbB2RU80 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PtprbB2RU80 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
PtprbB2RU80 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PtprbB2RU80 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
PtprbB2RU80 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PtprbB2RU80 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
PtprbB2RU80 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PtprbB2RU80 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
PtprbB2RU80 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PtprbB2RU80 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PtprbB2RU80 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PtprbB2RU80 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PtprbB2RU80 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PtprbB2RU80 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PtprbB2RU80 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
PtprbB2RU80 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PtprbB2RU80 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PtprbB2RU80 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PtprbB2RU80 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PtprbB2RU80 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PtprbB2RU80 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PtprbB2RU80 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
PtprbB2RU80 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PtprbB2RU80 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PtprbB2RU80 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PtprbB2RU80 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
PtprbB2RU80 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PtprbB2RU80 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PtprbB2RU80 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PtprbB2RU80 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PtprbB2RU80 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
PtprbB2RU80 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PtprbB2RU80 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PtprbB2RU80 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PtprbB2RU80 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PtprbB2RU80 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
PtprbB2RU80 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
PtprbB2RU80 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PtprbB2RU80 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PtprbB2RU80 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PtprbB2RU80 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
PtprbB2RU80 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PtprbB2RU80 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PtprbB2RU80 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PtprbB2RU80 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
PtprbB2RU80 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
PtprbB2RU80 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtprbB2RU80 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
PtprbB2RU80 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtprbB2RU80 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtprbB2RU80 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtprbB2RU80 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtprbB2RU80 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtprbB2RU80 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtprbB2RU80 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtprbB2RU80 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtprbB2RU80 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtprbB2RU80 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtprbB2RU80 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
PtprbB2RU80 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtprbB2RU80 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtprbB2RU80 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtprbB2RU80 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtprbB2RU80 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtprbB2RU80 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtprbB2RU80 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtprbB2RU80 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PtprbB2RU80 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtprbB2RU80 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtprbB2RU80 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtprbB2RU80 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtprbB2RU80 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtprbB2RU80 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtprbB2RU80 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
PtprbB2RU80 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
PtprbB2RU80 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtprbB2RU80 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtprbB2RU80 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
PtprbB2RU80 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms