Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Brpf1B2RRD7 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Brpf1B2RRD7 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Brpf1B2RRD7 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Brpf1B2RRD7 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Brpf1B2RRD7 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Brpf1B2RRD7 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Brpf1B2RRD7 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Brpf1B2RRD7 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Brpf1B2RRD7 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Brpf1B2RRD7 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Brpf1B2RRD7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Brpf1B2RRD7 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Brpf1B2RRD7 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Brpf1B2RRD7 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Brpf1B2RRD7 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Brpf1B2RRD7 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Brpf1B2RRD7 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Brpf1B2RRD7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Brpf1B2RRD7 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Brpf1B2RRD7 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Brpf1B2RRD7 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Brpf1B2RRD7 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Brpf1B2RRD7 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Brpf1B2RRD7 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Brpf1B2RRD7 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Brpf1B2RRD7 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Brpf1B2RRD7 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Brpf1B2RRD7 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Brpf1B2RRD7 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Brpf1B2RRD7 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Brpf1B2RRD7 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Brpf1B2RRD7 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Brpf1B2RRD7 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Brpf1B2RRD7 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Brpf1B2RRD7 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Brpf1B2RRD7 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Brpf1B2RRD7 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Brpf1B2RRD7 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Brpf1B2RRD7 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Brpf1B2RRD7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Brpf1B2RRD7 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Brpf1B2RRD7 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Brpf1B2RRD7 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Brpf1B2RRD7 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Brpf1B2RRD7 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Brpf1B2RRD7 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Brpf1B2RRD7 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Brpf1B2RRD7 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Brpf1B2RRD7 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Brpf1B2RRD7 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Brpf1B2RRD7 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Brpf1B2RRD7 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Brpf1B2RRD7 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Brpf1B2RRD7 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Brpf1B2RRD7 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Brpf1B2RRD7 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Brpf1B2RRD7 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Brpf1B2RRD7 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Brpf1B2RRD7 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Brpf1B2RRD7 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Brpf1B2RRD7 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Brpf1B2RRD7 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Brpf1B2RRD7 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Brpf1B2RRD7 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Brpf1B2RRD7 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Brpf1B2RRD7 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Brpf1B2RRD7 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Brpf1B2RRD7 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Brpf1B2RRD7 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Brpf1B2RRD7 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Brpf1B2RRD7 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Brpf1B2RRD7 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Brpf1B2RRD7 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Brpf1B2RRD7 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Brpf1B2RRD7 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Brpf1B2RRD7 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Brpf1B2RRD7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Brpf1B2RRD7 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Brpf1B2RRD7 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Brpf1B2RRD7 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Brpf1B2RRD7 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Brpf1B2RRD7 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Brpf1B2RRD7 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Brpf1B2RRD7 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Brpf1B2RRD7 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Brpf1B2RRD7 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Brpf1B2RRD7 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Brpf1B2RRD7 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Brpf1B2RRD7 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Brpf1B2RRD7 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Brpf1B2RRD7 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Brpf1B2RRD7 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Brpf1B2RRD7 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Brpf1B2RRD7 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Brpf1B2RRD7 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Brpf1B2RRD7 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Brpf1B2RRD7 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Brpf1B2RRD7 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Brpf1B2RRD7 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms