Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Trabd2bB1ATG9 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trabd2bB1ATG9 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trabd2bB1ATG9 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trabd2bB1ATG9 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trabd2bB1ATG9 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trabd2bB1ATG9 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trabd2bB1ATG9 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trabd2bB1ATG9 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trabd2bB1ATG9 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trabd2bB1ATG9 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trabd2bB1ATG9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trabd2bB1ATG9 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trabd2bB1ATG9 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Trabd2bB1ATG9 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trabd2bB1ATG9 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trabd2bB1ATG9 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trabd2bB1ATG9 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trabd2bB1ATG9 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trabd2bB1ATG9 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trabd2bB1ATG9 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trabd2bB1ATG9 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trabd2bB1ATG9 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trabd2bB1ATG9 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Trabd2bB1ATG9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trabd2bB1ATG9 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trabd2bB1ATG9 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trabd2bB1ATG9 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trabd2bB1ATG9 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trabd2bB1ATG9 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trabd2bB1ATG9 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Trabd2bB1ATG9 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trabd2bB1ATG9 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trabd2bB1ATG9 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trabd2bB1ATG9 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trabd2bB1ATG9 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trabd2bB1ATG9 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Trabd2bB1ATG9 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Trabd2bB1ATG9 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trabd2bB1ATG9 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trabd2bB1ATG9 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trabd2bB1ATG9 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trabd2bB1ATG9 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trabd2bB1ATG9 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trabd2bB1ATG9 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trabd2bB1ATG9 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trabd2bB1ATG9 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trabd2bB1ATG9 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Trabd2bB1ATG9 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
Trabd2bB1ATG9 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trabd2bB1ATG9 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trabd2bB1ATG9 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trabd2bB1ATG9 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trabd2bB1ATG9 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trabd2bB1ATG9 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Trabd2bB1ATG9 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trabd2bB1ATG9 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trabd2bB1ATG9 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trabd2bB1ATG9 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trabd2bB1ATG9 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trabd2bB1ATG9 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trabd2bB1ATG9 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Trabd2bB1ATG9 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trabd2bB1ATG9 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trabd2bB1ATG9 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Trabd2bB1ATG9 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trabd2bB1ATG9 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trabd2bB1ATG9 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trabd2bB1ATG9 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Trabd2bB1ATG9 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trabd2bB1ATG9 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trabd2bB1ATG9 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trabd2bB1ATG9 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trabd2bB1ATG9 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trabd2bB1ATG9 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trabd2bB1ATG9 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Trabd2bB1ATG9 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trabd2bB1ATG9 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trabd2bB1ATG9 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trabd2bB1ATG9 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trabd2bB1ATG9 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trabd2bB1ATG9 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trabd2bB1ATG9 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trabd2bB1ATG9 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Trabd2bB1ATG9 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trabd2bB1ATG9 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trabd2bB1ATG9 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trabd2bB1ATG9 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Trabd2bB1ATG9 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Trabd2bB1ATG9 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Trabd2bB1ATG9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trabd2bB1ATG9 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trabd2bB1ATG9 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Trabd2bB1ATG9 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trabd2bB1ATG9 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trabd2bB1ATG9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trabd2bB1ATG9 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trabd2bB1ATG9 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trabd2bB1ATG9 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Trabd2bB1ATG9 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
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