Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

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Length 208 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm6880A3KG45 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm6880A3KG45 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm6880A3KG45 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm6880A3KG45 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm6880A3KG45 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm6880A3KG45 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm6880A3KG45 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm6880A3KG45 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm6880A3KG45 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm6880A3KG45 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm6880A3KG45 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm6880A3KG45 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm6880A3KG45 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm6880A3KG45 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm6880A3KG45 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm6880A3KG45 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm6880A3KG45 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm6880A3KG45 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm6880A3KG45 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm6880A3KG45 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm6880A3KG45 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm6880A3KG45 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm6880A3KG45 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm6880A3KG45 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm6880A3KG45 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm6880A3KG45 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm6880A3KG45 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm6880A3KG45 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm6880A3KG45 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm6880A3KG45 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm6880A3KG45 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm6880A3KG45 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm6880A3KG45 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm6880A3KG45 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm6880A3KG45 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm6880A3KG45 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm6880A3KG45 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm6880A3KG45 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gm6880A3KG45 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm6880A3KG45 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm6880A3KG45 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm6880A3KG45 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gm6880A3KG45 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm6880A3KG45 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm6880A3KG45 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm6880A3KG45 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm6880A3KG45 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm6880A3KG45 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm6880A3KG45 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm6880A3KG45 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm6880A3KG45 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm6880A3KG45 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm6880A3KG45 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm6880A3KG45 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm6880A3KG45 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm6880A3KG45 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm6880A3KG45 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm6880A3KG45 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm6880A3KG45 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm6880A3KG45 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm6880A3KG45 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm6880A3KG45 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm6880A3KG45 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm6880A3KG45 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm6880A3KG45 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm6880A3KG45 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm6880A3KG45 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm6880A3KG45 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm6880A3KG45 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm6880A3KG45 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm6880A3KG45 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm6880A3KG45 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm6880A3KG45 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm6880A3KG45 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm6880A3KG45 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm6880A3KG45 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm6880A3KG45 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm6880A3KG45 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm6880A3KG45 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm6880A3KG45 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm6880A3KG45 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm6880A3KG45 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm6880A3KG45 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm6880A3KG45 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm6880A3KG45 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm6880A3KG45 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm6880A3KG45 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm6880A3KG45 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm6880A3KG45 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm6880A3KG45 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm6880A3KG45 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm6880A3KG45 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm6880A3KG45 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm6880A3KG45 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm6880A3KG45 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm6880A3KG45 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm6880A3KG45 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm6880A3KG45 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm6880A3KG45 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms