Protein–RNA interactions for Protein: A2AJ38

Gm13941, Predicted gene 13941 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm13941A2AJ38 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm13941A2AJ38 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm13941A2AJ38 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm13941A2AJ38 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm13941A2AJ38 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm13941A2AJ38 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm13941A2AJ38 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm13941A2AJ38 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm13941A2AJ38 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm13941A2AJ38 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm13941A2AJ38 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm13941A2AJ38 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm13941A2AJ38 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm13941A2AJ38 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm13941A2AJ38 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm13941A2AJ38 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm13941A2AJ38 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm13941A2AJ38 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm13941A2AJ38 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm13941A2AJ38 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm13941A2AJ38 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm13941A2AJ38 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm13941A2AJ38 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm13941A2AJ38 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm13941A2AJ38 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm13941A2AJ38 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm13941A2AJ38 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm13941A2AJ38 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm13941A2AJ38 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm13941A2AJ38 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm13941A2AJ38 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm13941A2AJ38 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm13941A2AJ38 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm13941A2AJ38 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm13941A2AJ38 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm13941A2AJ38 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm13941A2AJ38 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm13941A2AJ38 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm13941A2AJ38 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm13941A2AJ38 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm13941A2AJ38 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm13941A2AJ38 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm13941A2AJ38 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm13941A2AJ38 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm13941A2AJ38 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm13941A2AJ38 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm13941A2AJ38 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm13941A2AJ38 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm13941A2AJ38 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm13941A2AJ38 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm13941A2AJ38 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm13941A2AJ38 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm13941A2AJ38 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm13941A2AJ38 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm13941A2AJ38 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm13941A2AJ38 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm13941A2AJ38 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm13941A2AJ38 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm13941A2AJ38 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm13941A2AJ38 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm13941A2AJ38 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm13941A2AJ38 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm13941A2AJ38 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm13941A2AJ38 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm13941A2AJ38 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm13941A2AJ38 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm13941A2AJ38 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm13941A2AJ38 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm13941A2AJ38 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm13941A2AJ38 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm13941A2AJ38 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm13941A2AJ38 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm13941A2AJ38 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm13941A2AJ38 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm13941A2AJ38 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm13941A2AJ38 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm13941A2AJ38 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm13941A2AJ38 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm13941A2AJ38 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm13941A2AJ38 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm13941A2AJ38 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm13941A2AJ38 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm13941A2AJ38 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm13941A2AJ38 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm13941A2AJ38 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm13941A2AJ38 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm13941A2AJ38 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm13941A2AJ38 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm13941A2AJ38 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm13941A2AJ38 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm13941A2AJ38 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm13941A2AJ38 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm13941A2AJ38 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm13941A2AJ38 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm13941A2AJ38 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm13941A2AJ38 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm13941A2AJ38 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm13941A2AJ38 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm13941A2AJ38 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gm13941A2AJ38 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms