Protein–RNA interactions for Protein: A2A6Q5

Cdc27, Cell division cycle protein 27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc27A2A6Q5 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdc27A2A6Q5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdc27A2A6Q5 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Cdc27A2A6Q5 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdc27A2A6Q5 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdc27A2A6Q5 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdc27A2A6Q5 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdc27A2A6Q5 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdc27A2A6Q5 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdc27A2A6Q5 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdc27A2A6Q5 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdc27A2A6Q5 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdc27A2A6Q5 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdc27A2A6Q5 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Cdc27A2A6Q5 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdc27A2A6Q5 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdc27A2A6Q5 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdc27A2A6Q5 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdc27A2A6Q5 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdc27A2A6Q5 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdc27A2A6Q5 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Cdc27A2A6Q5 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdc27A2A6Q5 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdc27A2A6Q5 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdc27A2A6Q5 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdc27A2A6Q5 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdc27A2A6Q5 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdc27A2A6Q5 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdc27A2A6Q5 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdc27A2A6Q5 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Cdc27A2A6Q5 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdc27A2A6Q5 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdc27A2A6Q5 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdc27A2A6Q5 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdc27A2A6Q5 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdc27A2A6Q5 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdc27A2A6Q5 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdc27A2A6Q5 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdc27A2A6Q5 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdc27A2A6Q5 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdc27A2A6Q5 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdc27A2A6Q5 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdc27A2A6Q5 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdc27A2A6Q5 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdc27A2A6Q5 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdc27A2A6Q5 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cdc27A2A6Q5 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdc27A2A6Q5 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdc27A2A6Q5 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdc27A2A6Q5 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdc27A2A6Q5 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdc27A2A6Q5 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdc27A2A6Q5 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdc27A2A6Q5 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdc27A2A6Q5 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdc27A2A6Q5 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdc27A2A6Q5 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdc27A2A6Q5 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdc27A2A6Q5 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdc27A2A6Q5 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdc27A2A6Q5 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdc27A2A6Q5 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdc27A2A6Q5 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdc27A2A6Q5 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdc27A2A6Q5 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdc27A2A6Q5 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdc27A2A6Q5 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdc27A2A6Q5 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdc27A2A6Q5 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdc27A2A6Q5 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdc27A2A6Q5 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdc27A2A6Q5 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdc27A2A6Q5 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdc27A2A6Q5 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdc27A2A6Q5 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdc27A2A6Q5 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdc27A2A6Q5 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdc27A2A6Q5 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdc27A2A6Q5 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdc27A2A6Q5 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdc27A2A6Q5 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdc27A2A6Q5 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdc27A2A6Q5 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdc27A2A6Q5 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdc27A2A6Q5 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdc27A2A6Q5 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdc27A2A6Q5 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdc27A2A6Q5 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdc27A2A6Q5 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdc27A2A6Q5 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdc27A2A6Q5 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdc27A2A6Q5 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdc27A2A6Q5 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdc27A2A6Q5 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cdc27A2A6Q5 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdc27A2A6Q5 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdc27A2A6Q5 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdc27A2A6Q5 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdc27A2A6Q5 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdc27A2A6Q5 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.1 ms