Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H8

Igkv1-133, Immunoglobulin kappa variable 1-133 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Igkv1-133A0A0B4J1H8 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Igkv1-133A0A0B4J1H8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Igkv1-133A0A0B4J1H8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Igkv1-133A0A0B4J1H8 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Igkv1-133A0A0B4J1H8 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Igkv1-133A0A0B4J1H8 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Igkv1-133A0A0B4J1H8 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms