Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WPV9

1700019A02Rik, RIKEN cDNA 1700019A02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700019A02RikA0A087WPV9 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
1700019A02RikA0A087WPV9 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
1700019A02RikA0A087WPV9 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
1700019A02RikA0A087WPV9 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
1700019A02RikA0A087WPV9 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
1700019A02RikA0A087WPV9 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
1700019A02RikA0A087WPV9 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
1700019A02RikA0A087WPV9 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
1700019A02RikA0A087WPV9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
1700019A02RikA0A087WPV9 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
1700019A02RikA0A087WPV9 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
1700019A02RikA0A087WPV9 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
1700019A02RikA0A087WPV9 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
1700019A02RikA0A087WPV9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
1700019A02RikA0A087WPV9 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
1700019A02RikA0A087WPV9 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
1700019A02RikA0A087WPV9 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
1700019A02RikA0A087WPV9 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
1700019A02RikA0A087WPV9 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
1700019A02RikA0A087WPV9 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
1700019A02RikA0A087WPV9 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
1700019A02RikA0A087WPV9 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
1700019A02RikA0A087WPV9 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
1700019A02RikA0A087WPV9 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
1700019A02RikA0A087WPV9 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
1700019A02RikA0A087WPV9 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
1700019A02RikA0A087WPV9 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
1700019A02RikA0A087WPV9 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
1700019A02RikA0A087WPV9 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
1700019A02RikA0A087WPV9 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
1700019A02RikA0A087WPV9 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
1700019A02RikA0A087WPV9 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
1700019A02RikA0A087WPV9 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
1700019A02RikA0A087WPV9 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
1700019A02RikA0A087WPV9 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
1700019A02RikA0A087WPV9 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
1700019A02RikA0A087WPV9 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
1700019A02RikA0A087WPV9 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
1700019A02RikA0A087WPV9 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
1700019A02RikA0A087WPV9 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
1700019A02RikA0A087WPV9 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
1700019A02RikA0A087WPV9 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
1700019A02RikA0A087WPV9 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
1700019A02RikA0A087WPV9 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
1700019A02RikA0A087WPV9 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
1700019A02RikA0A087WPV9 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
1700019A02RikA0A087WPV9 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
1700019A02RikA0A087WPV9 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
1700019A02RikA0A087WPV9 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
1700019A02RikA0A087WPV9 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
1700019A02RikA0A087WPV9 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
1700019A02RikA0A087WPV9 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
1700019A02RikA0A087WPV9 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
1700019A02RikA0A087WPV9 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
1700019A02RikA0A087WPV9 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
1700019A02RikA0A087WPV9 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
1700019A02RikA0A087WPV9 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
1700019A02RikA0A087WPV9 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
1700019A02RikA0A087WPV9 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
1700019A02RikA0A087WPV9 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
1700019A02RikA0A087WPV9 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
1700019A02RikA0A087WPV9 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
1700019A02RikA0A087WPV9 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
1700019A02RikA0A087WPV9 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
1700019A02RikA0A087WPV9 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
1700019A02RikA0A087WPV9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
1700019A02RikA0A087WPV9 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
1700019A02RikA0A087WPV9 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
1700019A02RikA0A087WPV9 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
1700019A02RikA0A087WPV9 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
1700019A02RikA0A087WPV9 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
1700019A02RikA0A087WPV9 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
1700019A02RikA0A087WPV9 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
1700019A02RikA0A087WPV9 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
1700019A02RikA0A087WPV9 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
1700019A02RikA0A087WPV9 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
1700019A02RikA0A087WPV9 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
1700019A02RikA0A087WPV9 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
1700019A02RikA0A087WPV9 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
1700019A02RikA0A087WPV9 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
1700019A02RikA0A087WPV9 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
1700019A02RikA0A087WPV9 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
1700019A02RikA0A087WPV9 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
1700019A02RikA0A087WPV9 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
1700019A02RikA0A087WPV9 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
1700019A02RikA0A087WPV9 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
1700019A02RikA0A087WPV9 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
1700019A02RikA0A087WPV9 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
1700019A02RikA0A087WPV9 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
1700019A02RikA0A087WPV9 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
1700019A02RikA0A087WPV9 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
1700019A02RikA0A087WPV9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
1700019A02RikA0A087WPV9 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
1700019A02RikA0A087WPV9 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
1700019A02RikA0A087WPV9 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
1700019A02RikA0A087WPV9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75 ms