Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ubl3Q9Z2M6 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ubl3Q9Z2M6 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ubl3Q9Z2M6 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ubl3Q9Z2M6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ubl3Q9Z2M6 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ubl3Q9Z2M6 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ubl3Q9Z2M6 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ubl3Q9Z2M6 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ubl3Q9Z2M6 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ubl3Q9Z2M6 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ubl3Q9Z2M6 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ubl3Q9Z2M6 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ubl3Q9Z2M6 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Ubl3Q9Z2M6 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ubl3Q9Z2M6 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ubl3Q9Z2M6 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ubl3Q9Z2M6 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ubl3Q9Z2M6 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ubl3Q9Z2M6 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ubl3Q9Z2M6 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ubl3Q9Z2M6 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ubl3Q9Z2M6 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ubl3Q9Z2M6 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ubl3Q9Z2M6 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ubl3Q9Z2M6 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ubl3Q9Z2M6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ubl3Q9Z2M6 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ubl3Q9Z2M6 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ubl3Q9Z2M6 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ubl3Q9Z2M6 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ubl3Q9Z2M6 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ubl3Q9Z2M6 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ubl3Q9Z2M6 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ubl3Q9Z2M6 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ubl3Q9Z2M6 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ubl3Q9Z2M6 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ubl3Q9Z2M6 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ubl3Q9Z2M6 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ubl3Q9Z2M6 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ubl3Q9Z2M6 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ubl3Q9Z2M6 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ubl3Q9Z2M6 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ubl3Q9Z2M6 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ubl3Q9Z2M6 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ubl3Q9Z2M6 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ubl3Q9Z2M6 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ubl3Q9Z2M6 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ubl3Q9Z2M6 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ubl3Q9Z2M6 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ubl3Q9Z2M6 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ubl3Q9Z2M6 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ubl3Q9Z2M6 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ubl3Q9Z2M6 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ubl3Q9Z2M6 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ubl3Q9Z2M6 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ubl3Q9Z2M6 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ubl3Q9Z2M6 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ubl3Q9Z2M6 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ubl3Q9Z2M6 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ubl3Q9Z2M6 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ubl3Q9Z2M6 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ubl3Q9Z2M6 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ubl3Q9Z2M6 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ubl3Q9Z2M6 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ubl3Q9Z2M6 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ubl3Q9Z2M6 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ubl3Q9Z2M6 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ubl3Q9Z2M6 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ubl3Q9Z2M6 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ubl3Q9Z2M6 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ubl3Q9Z2M6 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ubl3Q9Z2M6 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ubl3Q9Z2M6 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ubl3Q9Z2M6 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ubl3Q9Z2M6 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ubl3Q9Z2M6 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ubl3Q9Z2M6 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ubl3Q9Z2M6 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ubl3Q9Z2M6 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ubl3Q9Z2M6 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ubl3Q9Z2M6 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ubl3Q9Z2M6 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ubl3Q9Z2M6 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ubl3Q9Z2M6 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ubl3Q9Z2M6 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ubl3Q9Z2M6 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ubl3Q9Z2M6 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ubl3Q9Z2M6 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ubl3Q9Z2M6 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ubl3Q9Z2M6 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ubl3Q9Z2M6 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ubl3Q9Z2M6 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ubl3Q9Z2M6 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Ubl3Q9Z2M6 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ubl3Q9Z2M6 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ubl3Q9Z2M6 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ubl3Q9Z2M6 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Ubl3Q9Z2M6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Ubl3Q9Z2M6 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms