Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV35

Apobec2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec2Q9WV35 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Apobec2Q9WV35 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Apobec2Q9WV35 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Apobec2Q9WV35 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Apobec2Q9WV35 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Apobec2Q9WV35 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Apobec2Q9WV35 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Apobec2Q9WV35 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Apobec2Q9WV35 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Apobec2Q9WV35 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Apobec2Q9WV35 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Apobec2Q9WV35 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Apobec2Q9WV35 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Apobec2Q9WV35 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Apobec2Q9WV35 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Apobec2Q9WV35 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Apobec2Q9WV35 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Apobec2Q9WV35 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Apobec2Q9WV35 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Apobec2Q9WV35 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Apobec2Q9WV35 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Apobec2Q9WV35 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Apobec2Q9WV35 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Apobec2Q9WV35 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Apobec2Q9WV35 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Apobec2Q9WV35 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Apobec2Q9WV35 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Apobec2Q9WV35 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Apobec2Q9WV35 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Apobec2Q9WV35 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Apobec2Q9WV35 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Apobec2Q9WV35 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Apobec2Q9WV35 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Apobec2Q9WV35 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Apobec2Q9WV35 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Apobec2Q9WV35 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Apobec2Q9WV35 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Apobec2Q9WV35 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Apobec2Q9WV35 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Apobec2Q9WV35 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Apobec2Q9WV35 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Apobec2Q9WV35 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Apobec2Q9WV35 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Apobec2Q9WV35 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Apobec2Q9WV35 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Apobec2Q9WV35 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Apobec2Q9WV35 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Apobec2Q9WV35 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Apobec2Q9WV35 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Apobec2Q9WV35 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Apobec2Q9WV35 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Apobec2Q9WV35 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Apobec2Q9WV35 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Apobec2Q9WV35 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Apobec2Q9WV35 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Apobec2Q9WV35 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Apobec2Q9WV35 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Apobec2Q9WV35 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Apobec2Q9WV35 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Apobec2Q9WV35 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Apobec2Q9WV35 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Apobec2Q9WV35 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Apobec2Q9WV35 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Apobec2Q9WV35 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Apobec2Q9WV35 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Apobec2Q9WV35 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Apobec2Q9WV35 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Apobec2Q9WV35 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Apobec2Q9WV35 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Apobec2Q9WV35 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Apobec2Q9WV35 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Apobec2Q9WV35 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Apobec2Q9WV35 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Apobec2Q9WV35 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Apobec2Q9WV35 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Apobec2Q9WV35 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Apobec2Q9WV35 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Apobec2Q9WV35 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Apobec2Q9WV35 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Apobec2Q9WV35 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Apobec2Q9WV35 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Apobec2Q9WV35 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Apobec2Q9WV35 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Apobec2Q9WV35 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Apobec2Q9WV35 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Apobec2Q9WV35 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Apobec2Q9WV35 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Apobec2Q9WV35 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Apobec2Q9WV35 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Apobec2Q9WV35 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Apobec2Q9WV35 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Apobec2Q9WV35 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Apobec2Q9WV35 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Apobec2Q9WV35 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Apobec2Q9WV35 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Apobec2Q9WV35 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Apobec2Q9WV35 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Apobec2Q9WV35 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Apobec2Q9WV35 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Apobec2Q9WV35 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89 ms