Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTR1

Trpv2, Transient receptor potential cation channel subfamily V member 2, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpv2Q9WTR1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trpv2Q9WTR1 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trpv2Q9WTR1 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trpv2Q9WTR1 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trpv2Q9WTR1 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Trpv2Q9WTR1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trpv2Q9WTR1 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trpv2Q9WTR1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Trpv2Q9WTR1 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Trpv2Q9WTR1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trpv2Q9WTR1 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Trpv2Q9WTR1 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Trpv2Q9WTR1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trpv2Q9WTR1 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trpv2Q9WTR1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trpv2Q9WTR1 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trpv2Q9WTR1 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trpv2Q9WTR1 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trpv2Q9WTR1 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trpv2Q9WTR1 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Trpv2Q9WTR1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trpv2Q9WTR1 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trpv2Q9WTR1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trpv2Q9WTR1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trpv2Q9WTR1 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trpv2Q9WTR1 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trpv2Q9WTR1 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Trpv2Q9WTR1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trpv2Q9WTR1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trpv2Q9WTR1 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trpv2Q9WTR1 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trpv2Q9WTR1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trpv2Q9WTR1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trpv2Q9WTR1 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trpv2Q9WTR1 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trpv2Q9WTR1 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Trpv2Q9WTR1 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trpv2Q9WTR1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trpv2Q9WTR1 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Trpv2Q9WTR1 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trpv2Q9WTR1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trpv2Q9WTR1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trpv2Q9WTR1 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trpv2Q9WTR1 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trpv2Q9WTR1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trpv2Q9WTR1 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trpv2Q9WTR1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trpv2Q9WTR1 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Trpv2Q9WTR1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trpv2Q9WTR1 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trpv2Q9WTR1 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trpv2Q9WTR1 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trpv2Q9WTR1 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Trpv2Q9WTR1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Trpv2Q9WTR1 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Trpv2Q9WTR1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Trpv2Q9WTR1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Trpv2Q9WTR1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Trpv2Q9WTR1 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Trpv2Q9WTR1 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trpv2Q9WTR1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Trpv2Q9WTR1 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Trpv2Q9WTR1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trpv2Q9WTR1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trpv2Q9WTR1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trpv2Q9WTR1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trpv2Q9WTR1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trpv2Q9WTR1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trpv2Q9WTR1 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trpv2Q9WTR1 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trpv2Q9WTR1 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Trpv2Q9WTR1 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trpv2Q9WTR1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trpv2Q9WTR1 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trpv2Q9WTR1 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trpv2Q9WTR1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trpv2Q9WTR1 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trpv2Q9WTR1 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trpv2Q9WTR1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trpv2Q9WTR1 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trpv2Q9WTR1 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trpv2Q9WTR1 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trpv2Q9WTR1 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trpv2Q9WTR1 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trpv2Q9WTR1 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trpv2Q9WTR1 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trpv2Q9WTR1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trpv2Q9WTR1 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trpv2Q9WTR1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trpv2Q9WTR1 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trpv2Q9WTR1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trpv2Q9WTR1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trpv2Q9WTR1 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trpv2Q9WTR1 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trpv2Q9WTR1 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Trpv2Q9WTR1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trpv2Q9WTR1 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trpv2Q9WTR1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trpv2Q9WTR1 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trpv2Q9WTR1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms