Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZF2

Gpc1, Glypican-1, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc1Q9QZF2 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Gpc1Q9QZF2 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gpc1Q9QZF2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gpc1Q9QZF2 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gpc1Q9QZF2 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gpc1Q9QZF2 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gpc1Q9QZF2 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Gpc1Q9QZF2 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Gpc1Q9QZF2 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Gpc1Q9QZF2 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gpc1Q9QZF2 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gpc1Q9QZF2 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gpc1Q9QZF2 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gpc1Q9QZF2 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Gpc1Q9QZF2 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gpc1Q9QZF2 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gpc1Q9QZF2 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gpc1Q9QZF2 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gpc1Q9QZF2 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gpc1Q9QZF2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Gpc1Q9QZF2 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Gpc1Q9QZF2 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gpc1Q9QZF2 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gpc1Q9QZF2 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gpc1Q9QZF2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gpc1Q9QZF2 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gpc1Q9QZF2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gpc1Q9QZF2 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gpc1Q9QZF2 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Gpc1Q9QZF2 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gpc1Q9QZF2 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gpc1Q9QZF2 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gpc1Q9QZF2 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gpc1Q9QZF2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gpc1Q9QZF2 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gpc1Q9QZF2 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gpc1Q9QZF2 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Gpc1Q9QZF2 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gpc1Q9QZF2 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gpc1Q9QZF2 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gpc1Q9QZF2 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gpc1Q9QZF2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gpc1Q9QZF2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Gpc1Q9QZF2 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gpc1Q9QZF2 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gpc1Q9QZF2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gpc1Q9QZF2 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gpc1Q9QZF2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gpc1Q9QZF2 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gpc1Q9QZF2 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Gpc1Q9QZF2 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gpc1Q9QZF2 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gpc1Q9QZF2 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gpc1Q9QZF2 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gpc1Q9QZF2 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gpc1Q9QZF2 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gpc1Q9QZF2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gpc1Q9QZF2 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gpc1Q9QZF2 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gpc1Q9QZF2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Gpc1Q9QZF2 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gpc1Q9QZF2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gpc1Q9QZF2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Gpc1Q9QZF2 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gpc1Q9QZF2 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gpc1Q9QZF2 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gpc1Q9QZF2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Gpc1Q9QZF2 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gpc1Q9QZF2 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gpc1Q9QZF2 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gpc1Q9QZF2 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gpc1Q9QZF2 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gpc1Q9QZF2 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gpc1Q9QZF2 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gpc1Q9QZF2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gpc1Q9QZF2 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gpc1Q9QZF2 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gpc1Q9QZF2 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gpc1Q9QZF2 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Gpc1Q9QZF2 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gpc1Q9QZF2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gpc1Q9QZF2 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gpc1Q9QZF2 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gpc1Q9QZF2 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gpc1Q9QZF2 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gpc1Q9QZF2 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gpc1Q9QZF2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gpc1Q9QZF2 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gpc1Q9QZF2 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gpc1Q9QZF2 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gpc1Q9QZF2 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gpc1Q9QZF2 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gpc1Q9QZF2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Gpc1Q9QZF2 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Gpc1Q9QZF2 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gpc1Q9QZF2 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Gpc1Q9QZF2 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Gpc1Q9QZF2 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gpc1Q9QZF2 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Gpc1Q9QZF2 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms