Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ28

Six6, Homeobox protein SIX6, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six6Q9QZ28 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Six6Q9QZ28 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Six6Q9QZ28 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Six6Q9QZ28 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Six6Q9QZ28 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Six6Q9QZ28 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Six6Q9QZ28 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Six6Q9QZ28 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Six6Q9QZ28 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Six6Q9QZ28 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Six6Q9QZ28 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Six6Q9QZ28 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Six6Q9QZ28 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Six6Q9QZ28 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Six6Q9QZ28 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Six6Q9QZ28 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Six6Q9QZ28 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Six6Q9QZ28 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Six6Q9QZ28 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Six6Q9QZ28 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Six6Q9QZ28 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Six6Q9QZ28 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Six6Q9QZ28 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Six6Q9QZ28 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Six6Q9QZ28 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Six6Q9QZ28 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Six6Q9QZ28 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Six6Q9QZ28 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Six6Q9QZ28 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Six6Q9QZ28 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Six6Q9QZ28 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Six6Q9QZ28 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Six6Q9QZ28 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Six6Q9QZ28 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Six6Q9QZ28 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Six6Q9QZ28 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Six6Q9QZ28 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Six6Q9QZ28 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Six6Q9QZ28 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Six6Q9QZ28 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Six6Q9QZ28 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Six6Q9QZ28 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Six6Q9QZ28 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Six6Q9QZ28 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Six6Q9QZ28 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Six6Q9QZ28 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Six6Q9QZ28 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Six6Q9QZ28 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Six6Q9QZ28 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Six6Q9QZ28 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Six6Q9QZ28 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Six6Q9QZ28 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Six6Q9QZ28 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Six6Q9QZ28 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Six6Q9QZ28 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Six6Q9QZ28 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Six6Q9QZ28 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Six6Q9QZ28 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Six6Q9QZ28 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Six6Q9QZ28 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Six6Q9QZ28 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Six6Q9QZ28 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Six6Q9QZ28 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Six6Q9QZ28 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Six6Q9QZ28 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Six6Q9QZ28 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Six6Q9QZ28 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Six6Q9QZ28 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Six6Q9QZ28 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Six6Q9QZ28 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Six6Q9QZ28 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Six6Q9QZ28 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Six6Q9QZ28 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Six6Q9QZ28 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Six6Q9QZ28 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Six6Q9QZ28 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Six6Q9QZ28 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Six6Q9QZ28 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Six6Q9QZ28 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Six6Q9QZ28 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Six6Q9QZ28 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Six6Q9QZ28 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Six6Q9QZ28 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Six6Q9QZ28 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Six6Q9QZ28 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Six6Q9QZ28 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Six6Q9QZ28 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Six6Q9QZ28 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Six6Q9QZ28 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Six6Q9QZ28 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Six6Q9QZ28 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Six6Q9QZ28 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Six6Q9QZ28 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Six6Q9QZ28 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Six6Q9QZ28 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Six6Q9QZ28 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Six6Q9QZ28 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Six6Q9QZ28 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Six6Q9QZ28 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Six6Q9QZ28 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.6 ms