Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYY8

Spast, Spastin, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpastQ9QYY8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SpastQ9QYY8 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SpastQ9QYY8 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SpastQ9QYY8 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SpastQ9QYY8 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SpastQ9QYY8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SpastQ9QYY8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SpastQ9QYY8 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SpastQ9QYY8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SpastQ9QYY8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SpastQ9QYY8 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SpastQ9QYY8 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SpastQ9QYY8 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SpastQ9QYY8 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SpastQ9QYY8 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SpastQ9QYY8 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SpastQ9QYY8 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SpastQ9QYY8 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SpastQ9QYY8 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SpastQ9QYY8 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SpastQ9QYY8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SpastQ9QYY8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SpastQ9QYY8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SpastQ9QYY8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SpastQ9QYY8 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SpastQ9QYY8 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SpastQ9QYY8 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SpastQ9QYY8 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SpastQ9QYY8 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SpastQ9QYY8 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SpastQ9QYY8 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SpastQ9QYY8 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SpastQ9QYY8 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SpastQ9QYY8 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SpastQ9QYY8 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SpastQ9QYY8 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SpastQ9QYY8 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SpastQ9QYY8 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SpastQ9QYY8 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SpastQ9QYY8 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SpastQ9QYY8 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SpastQ9QYY8 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SpastQ9QYY8 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SpastQ9QYY8 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SpastQ9QYY8 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SpastQ9QYY8 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SpastQ9QYY8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SpastQ9QYY8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SpastQ9QYY8 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SpastQ9QYY8 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
SpastQ9QYY8 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SpastQ9QYY8 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SpastQ9QYY8 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SpastQ9QYY8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SpastQ9QYY8 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SpastQ9QYY8 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SpastQ9QYY8 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SpastQ9QYY8 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SpastQ9QYY8 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SpastQ9QYY8 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SpastQ9QYY8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SpastQ9QYY8 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SpastQ9QYY8 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SpastQ9QYY8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SpastQ9QYY8 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SpastQ9QYY8 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SpastQ9QYY8 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SpastQ9QYY8 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SpastQ9QYY8 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SpastQ9QYY8 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SpastQ9QYY8 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SpastQ9QYY8 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SpastQ9QYY8 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SpastQ9QYY8 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SpastQ9QYY8 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SpastQ9QYY8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SpastQ9QYY8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SpastQ9QYY8 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SpastQ9QYY8 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SpastQ9QYY8 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SpastQ9QYY8 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SpastQ9QYY8 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SpastQ9QYY8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SpastQ9QYY8 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SpastQ9QYY8 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SpastQ9QYY8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SpastQ9QYY8 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SpastQ9QYY8 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SpastQ9QYY8 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SpastQ9QYY8 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SpastQ9QYY8 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SpastQ9QYY8 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SpastQ9QYY8 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SpastQ9QYY8 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SpastQ9QYY8 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SpastQ9QYY8 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SpastQ9QYY8 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SpastQ9QYY8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SpastQ9QYY8 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SpastQ9QYY8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms