Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA5

Lsm4, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm4Q9QXA5 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lsm4Q9QXA5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lsm4Q9QXA5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Lsm4Q9QXA5 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lsm4Q9QXA5 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lsm4Q9QXA5 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lsm4Q9QXA5 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lsm4Q9QXA5 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lsm4Q9QXA5 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lsm4Q9QXA5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lsm4Q9QXA5 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lsm4Q9QXA5 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Lsm4Q9QXA5 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Lsm4Q9QXA5 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Lsm4Q9QXA5 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Lsm4Q9QXA5 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lsm4Q9QXA5 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lsm4Q9QXA5 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lsm4Q9QXA5 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lsm4Q9QXA5 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lsm4Q9QXA5 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lsm4Q9QXA5 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lsm4Q9QXA5 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lsm4Q9QXA5 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lsm4Q9QXA5 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Lsm4Q9QXA5 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lsm4Q9QXA5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Lsm4Q9QXA5 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lsm4Q9QXA5 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lsm4Q9QXA5 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lsm4Q9QXA5 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lsm4Q9QXA5 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lsm4Q9QXA5 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lsm4Q9QXA5 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lsm4Q9QXA5 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lsm4Q9QXA5 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lsm4Q9QXA5 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lsm4Q9QXA5 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lsm4Q9QXA5 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lsm4Q9QXA5 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lsm4Q9QXA5 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lsm4Q9QXA5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lsm4Q9QXA5 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lsm4Q9QXA5 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Lsm4Q9QXA5 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lsm4Q9QXA5 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lsm4Q9QXA5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lsm4Q9QXA5 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lsm4Q9QXA5 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lsm4Q9QXA5 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lsm4Q9QXA5 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Lsm4Q9QXA5 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lsm4Q9QXA5 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lsm4Q9QXA5 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lsm4Q9QXA5 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lsm4Q9QXA5 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lsm4Q9QXA5 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lsm4Q9QXA5 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lsm4Q9QXA5 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Lsm4Q9QXA5 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lsm4Q9QXA5 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lsm4Q9QXA5 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lsm4Q9QXA5 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Lsm4Q9QXA5 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lsm4Q9QXA5 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lsm4Q9QXA5 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lsm4Q9QXA5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lsm4Q9QXA5 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lsm4Q9QXA5 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lsm4Q9QXA5 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lsm4Q9QXA5 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lsm4Q9QXA5 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lsm4Q9QXA5 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Lsm4Q9QXA5 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lsm4Q9QXA5 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lsm4Q9QXA5 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lsm4Q9QXA5 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lsm4Q9QXA5 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Lsm4Q9QXA5 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Lsm4Q9QXA5 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lsm4Q9QXA5 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lsm4Q9QXA5 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lsm4Q9QXA5 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lsm4Q9QXA5 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Lsm4Q9QXA5 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lsm4Q9QXA5 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lsm4Q9QXA5 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lsm4Q9QXA5 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lsm4Q9QXA5 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lsm4Q9QXA5 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lsm4Q9QXA5 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lsm4Q9QXA5 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lsm4Q9QXA5 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Lsm4Q9QXA5 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Lsm4Q9QXA5 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lsm4Q9QXA5 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lsm4Q9QXA5 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lsm4Q9QXA5 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lsm4Q9QXA5 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Lsm4Q9QXA5 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms