Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWT9

Kifc1, Kinesin-like protein KIFC1, mousemouse

Predictions only

Length 674 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kifc1Q9QWT9 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kifc1Q9QWT9 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kifc1Q9QWT9 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kifc1Q9QWT9 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kifc1Q9QWT9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kifc1Q9QWT9 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kifc1Q9QWT9 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kifc1Q9QWT9 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Kifc1Q9QWT9 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Kifc1Q9QWT9 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kifc1Q9QWT9 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kifc1Q9QWT9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kifc1Q9QWT9 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kifc1Q9QWT9 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Kifc1Q9QWT9 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kifc1Q9QWT9 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kifc1Q9QWT9 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kifc1Q9QWT9 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kifc1Q9QWT9 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kifc1Q9QWT9 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kifc1Q9QWT9 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kifc1Q9QWT9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Kifc1Q9QWT9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kifc1Q9QWT9 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kifc1Q9QWT9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Kifc1Q9QWT9 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Kifc1Q9QWT9 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Kifc1Q9QWT9 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Kifc1Q9QWT9 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Kifc1Q9QWT9 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Kifc1Q9QWT9 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Kifc1Q9QWT9 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Kifc1Q9QWT9 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Kifc1Q9QWT9 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Kifc1Q9QWT9 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Kifc1Q9QWT9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Kifc1Q9QWT9 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Kifc1Q9QWT9 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Kifc1Q9QWT9 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Kifc1Q9QWT9 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Kifc1Q9QWT9 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Kifc1Q9QWT9 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kifc1Q9QWT9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kifc1Q9QWT9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kifc1Q9QWT9 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kifc1Q9QWT9 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kifc1Q9QWT9 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kifc1Q9QWT9 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Kifc1Q9QWT9 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Kifc1Q9QWT9 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Kifc1Q9QWT9 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Kifc1Q9QWT9 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Kifc1Q9QWT9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Kifc1Q9QWT9 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Kifc1Q9QWT9 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Kifc1Q9QWT9 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Kifc1Q9QWT9 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Kifc1Q9QWT9 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Kifc1Q9QWT9 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Kifc1Q9QWT9 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Kifc1Q9QWT9 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Kifc1Q9QWT9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kifc1Q9QWT9 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Kifc1Q9QWT9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kifc1Q9QWT9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Kifc1Q9QWT9 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kifc1Q9QWT9 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Kifc1Q9QWT9 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kifc1Q9QWT9 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kifc1Q9QWT9 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Kifc1Q9QWT9 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kifc1Q9QWT9 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kifc1Q9QWT9 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kifc1Q9QWT9 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kifc1Q9QWT9 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kifc1Q9QWT9 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kifc1Q9QWT9 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Kifc1Q9QWT9 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kifc1Q9QWT9 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kifc1Q9QWT9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kifc1Q9QWT9 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kifc1Q9QWT9 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kifc1Q9QWT9 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kifc1Q9QWT9 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kifc1Q9QWT9 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Kifc1Q9QWT9 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Kifc1Q9QWT9 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Kifc1Q9QWT9 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Kifc1Q9QWT9 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Kifc1Q9QWT9 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Kifc1Q9QWT9 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Kifc1Q9QWT9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Kifc1Q9QWT9 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Kifc1Q9QWT9 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Kifc1Q9QWT9 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Kifc1Q9QWT9 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kifc1Q9QWT9 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kifc1Q9QWT9 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kifc1Q9QWT9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Kifc1Q9QWT9 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms