Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJY4

Ddx20, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX20, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 825 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx20Q9JJY4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ddx20Q9JJY4 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ddx20Q9JJY4 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Ddx20Q9JJY4 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ddx20Q9JJY4 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ddx20Q9JJY4 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ddx20Q9JJY4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ddx20Q9JJY4 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ddx20Q9JJY4 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ddx20Q9JJY4 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ddx20Q9JJY4 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ddx20Q9JJY4 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ddx20Q9JJY4 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ddx20Q9JJY4 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ddx20Q9JJY4 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ddx20Q9JJY4 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ddx20Q9JJY4 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ddx20Q9JJY4 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ddx20Q9JJY4 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ddx20Q9JJY4 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Ddx20Q9JJY4 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ddx20Q9JJY4 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ddx20Q9JJY4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ddx20Q9JJY4 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ddx20Q9JJY4 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ddx20Q9JJY4 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ddx20Q9JJY4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ddx20Q9JJY4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ddx20Q9JJY4 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ddx20Q9JJY4 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ddx20Q9JJY4 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ddx20Q9JJY4 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ddx20Q9JJY4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ddx20Q9JJY4 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ddx20Q9JJY4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ddx20Q9JJY4 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ddx20Q9JJY4 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ddx20Q9JJY4 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ddx20Q9JJY4 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ddx20Q9JJY4 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Ddx20Q9JJY4 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ddx20Q9JJY4 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ddx20Q9JJY4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ddx20Q9JJY4 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ddx20Q9JJY4 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ddx20Q9JJY4 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ddx20Q9JJY4 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ddx20Q9JJY4 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ddx20Q9JJY4 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ddx20Q9JJY4 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ddx20Q9JJY4 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ddx20Q9JJY4 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ddx20Q9JJY4 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Ddx20Q9JJY4 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ddx20Q9JJY4 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ddx20Q9JJY4 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ddx20Q9JJY4 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ddx20Q9JJY4 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ddx20Q9JJY4 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ddx20Q9JJY4 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ddx20Q9JJY4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ddx20Q9JJY4 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ddx20Q9JJY4 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ddx20Q9JJY4 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ddx20Q9JJY4 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ddx20Q9JJY4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ddx20Q9JJY4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ddx20Q9JJY4 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ddx20Q9JJY4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ddx20Q9JJY4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ddx20Q9JJY4 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ddx20Q9JJY4 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ddx20Q9JJY4 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ddx20Q9JJY4 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ddx20Q9JJY4 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ddx20Q9JJY4 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ddx20Q9JJY4 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ddx20Q9JJY4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ddx20Q9JJY4 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ddx20Q9JJY4 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ddx20Q9JJY4 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ddx20Q9JJY4 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ddx20Q9JJY4 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ddx20Q9JJY4 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ddx20Q9JJY4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ddx20Q9JJY4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ddx20Q9JJY4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ddx20Q9JJY4 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ddx20Q9JJY4 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ddx20Q9JJY4 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ddx20Q9JJY4 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Ddx20Q9JJY4 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ddx20Q9JJY4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ddx20Q9JJY4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ddx20Q9JJY4 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ddx20Q9JJY4 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ddx20Q9JJY4 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ddx20Q9JJY4 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ddx20Q9JJY4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ddx20Q9JJY4 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
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