Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJS6

Bco1, Beta,beta-carotene 15,15'-dioxygenase, mousemouse

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Length 566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco1Q9JJS6 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bco1Q9JJS6 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bco1Q9JJS6 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bco1Q9JJS6 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bco1Q9JJS6 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Bco1Q9JJS6 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Bco1Q9JJS6 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Bco1Q9JJS6 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bco1Q9JJS6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bco1Q9JJS6 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Bco1Q9JJS6 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bco1Q9JJS6 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bco1Q9JJS6 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Bco1Q9JJS6 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bco1Q9JJS6 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Bco1Q9JJS6 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Bco1Q9JJS6 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Bco1Q9JJS6 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Bco1Q9JJS6 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Bco1Q9JJS6 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Bco1Q9JJS6 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bco1Q9JJS6 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bco1Q9JJS6 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bco1Q9JJS6 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bco1Q9JJS6 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bco1Q9JJS6 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bco1Q9JJS6 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bco1Q9JJS6 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bco1Q9JJS6 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bco1Q9JJS6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bco1Q9JJS6 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bco1Q9JJS6 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bco1Q9JJS6 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bco1Q9JJS6 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bco1Q9JJS6 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Bco1Q9JJS6 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bco1Q9JJS6 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bco1Q9JJS6 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bco1Q9JJS6 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bco1Q9JJS6 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bco1Q9JJS6 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Bco1Q9JJS6 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Bco1Q9JJS6 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bco1Q9JJS6 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bco1Q9JJS6 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bco1Q9JJS6 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bco1Q9JJS6 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bco1Q9JJS6 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bco1Q9JJS6 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Bco1Q9JJS6 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Bco1Q9JJS6 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bco1Q9JJS6 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Bco1Q9JJS6 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Bco1Q9JJS6 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Bco1Q9JJS6 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Bco1Q9JJS6 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bco1Q9JJS6 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bco1Q9JJS6 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bco1Q9JJS6 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bco1Q9JJS6 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Bco1Q9JJS6 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bco1Q9JJS6 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bco1Q9JJS6 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Bco1Q9JJS6 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bco1Q9JJS6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bco1Q9JJS6 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bco1Q9JJS6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bco1Q9JJS6 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bco1Q9JJS6 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Bco1Q9JJS6 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bco1Q9JJS6 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Bco1Q9JJS6 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bco1Q9JJS6 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bco1Q9JJS6 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Bco1Q9JJS6 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bco1Q9JJS6 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bco1Q9JJS6 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bco1Q9JJS6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bco1Q9JJS6 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Bco1Q9JJS6 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Bco1Q9JJS6 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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