Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIL2

Ccl28, C-C motif chemokine 28, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl28Q9JIL2 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl28Q9JIL2 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl28Q9JIL2 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl28Q9JIL2 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl28Q9JIL2 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl28Q9JIL2 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl28Q9JIL2 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl28Q9JIL2 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl28Q9JIL2 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl28Q9JIL2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl28Q9JIL2 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl28Q9JIL2 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl28Q9JIL2 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl28Q9JIL2 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl28Q9JIL2 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ccl28Q9JIL2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl28Q9JIL2 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl28Q9JIL2 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl28Q9JIL2 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl28Q9JIL2 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl28Q9JIL2 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl28Q9JIL2 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl28Q9JIL2 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ccl28Q9JIL2 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl28Q9JIL2 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl28Q9JIL2 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl28Q9JIL2 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl28Q9JIL2 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl28Q9JIL2 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl28Q9JIL2 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl28Q9JIL2 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl28Q9JIL2 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl28Q9JIL2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl28Q9JIL2 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl28Q9JIL2 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl28Q9JIL2 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ccl28Q9JIL2 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl28Q9JIL2 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl28Q9JIL2 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl28Q9JIL2 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl28Q9JIL2 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl28Q9JIL2 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl28Q9JIL2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl28Q9JIL2 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl28Q9JIL2 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl28Q9JIL2 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl28Q9JIL2 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl28Q9JIL2 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl28Q9JIL2 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl28Q9JIL2 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl28Q9JIL2 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl28Q9JIL2 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ccl28Q9JIL2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccl28Q9JIL2 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccl28Q9JIL2 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccl28Q9JIL2 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccl28Q9JIL2 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccl28Q9JIL2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccl28Q9JIL2 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccl28Q9JIL2 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ccl28Q9JIL2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccl28Q9JIL2 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccl28Q9JIL2 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccl28Q9JIL2 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ccl28Q9JIL2 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl28Q9JIL2 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl28Q9JIL2 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl28Q9JIL2 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl28Q9JIL2 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl28Q9JIL2 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl28Q9JIL2 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl28Q9JIL2 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl28Q9JIL2 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl28Q9JIL2 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl28Q9JIL2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl28Q9JIL2 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl28Q9JIL2 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ccl28Q9JIL2 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl28Q9JIL2 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccl28Q9JIL2 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl28Q9JIL2 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl28Q9JIL2 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl28Q9JIL2 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccl28Q9JIL2 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl28Q9JIL2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl28Q9JIL2 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ccl28Q9JIL2 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl28Q9JIL2 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl28Q9JIL2 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ccl28Q9JIL2 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl28Q9JIL2 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl28Q9JIL2 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl28Q9JIL2 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl28Q9JIL2 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl28Q9JIL2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl28Q9JIL2 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl28Q9JIL2 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ccl28Q9JIL2 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl28Q9JIL2 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ccl28Q9JIL2 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms