Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES61

Ms4a4b, Chandra protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4bQ9ES61 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ms4a4bQ9ES61 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ms4a4bQ9ES61 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ms4a4bQ9ES61 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ms4a4bQ9ES61 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ms4a4bQ9ES61 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ms4a4bQ9ES61 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ms4a4bQ9ES61 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ms4a4bQ9ES61 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ms4a4bQ9ES61 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ms4a4bQ9ES61 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ms4a4bQ9ES61 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ms4a4bQ9ES61 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ms4a4bQ9ES61 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ms4a4bQ9ES61 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ms4a4bQ9ES61 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ms4a4bQ9ES61 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ms4a4bQ9ES61 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ms4a4bQ9ES61 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ms4a4bQ9ES61 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ms4a4bQ9ES61 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ms4a4bQ9ES61 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ms4a4bQ9ES61 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ms4a4bQ9ES61 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Ms4a4bQ9ES61 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ms4a4bQ9ES61 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ms4a4bQ9ES61 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ms4a4bQ9ES61 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ms4a4bQ9ES61 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ms4a4bQ9ES61 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ms4a4bQ9ES61 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ms4a4bQ9ES61 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ms4a4bQ9ES61 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ms4a4bQ9ES61 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ms4a4bQ9ES61 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ms4a4bQ9ES61 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ms4a4bQ9ES61 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ms4a4bQ9ES61 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ms4a4bQ9ES61 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ms4a4bQ9ES61 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ms4a4bQ9ES61 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ms4a4bQ9ES61 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ms4a4bQ9ES61 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ms4a4bQ9ES61 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ms4a4bQ9ES61 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ms4a4bQ9ES61 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ms4a4bQ9ES61 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ms4a4bQ9ES61 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ms4a4bQ9ES61 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ms4a4bQ9ES61 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ms4a4bQ9ES61 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ms4a4bQ9ES61 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ms4a4bQ9ES61 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ms4a4bQ9ES61 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ms4a4bQ9ES61 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ms4a4bQ9ES61 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ms4a4bQ9ES61 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ms4a4bQ9ES61 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ms4a4bQ9ES61 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ms4a4bQ9ES61 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ms4a4bQ9ES61 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ms4a4bQ9ES61 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ms4a4bQ9ES61 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ms4a4bQ9ES61 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ms4a4bQ9ES61 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ms4a4bQ9ES61 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ms4a4bQ9ES61 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ms4a4bQ9ES61 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ms4a4bQ9ES61 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ms4a4bQ9ES61 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ms4a4bQ9ES61 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ms4a4bQ9ES61 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ms4a4bQ9ES61 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ms4a4bQ9ES61 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ms4a4bQ9ES61 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ms4a4bQ9ES61 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ms4a4bQ9ES61 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ms4a4bQ9ES61 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ms4a4bQ9ES61 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ms4a4bQ9ES61 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ms4a4bQ9ES61 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ms4a4bQ9ES61 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ms4a4bQ9ES61 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ms4a4bQ9ES61 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ms4a4bQ9ES61 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ms4a4bQ9ES61 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ms4a4bQ9ES61 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ms4a4bQ9ES61 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ms4a4bQ9ES61 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ms4a4bQ9ES61 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ms4a4bQ9ES61 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ms4a4bQ9ES61 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ms4a4bQ9ES61 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ms4a4bQ9ES61 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ms4a4bQ9ES61 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ms4a4bQ9ES61 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a4bQ9ES61 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a4bQ9ES61 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a4bQ9ES61 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ms4a4bQ9ES61 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms