Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERA0

Tfcp2, Alpha-globin transcription factor CP2, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfcp2Q9ERA0 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tfcp2Q9ERA0 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tfcp2Q9ERA0 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tfcp2Q9ERA0 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tfcp2Q9ERA0 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tfcp2Q9ERA0 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tfcp2Q9ERA0 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tfcp2Q9ERA0 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tfcp2Q9ERA0 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tfcp2Q9ERA0 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tfcp2Q9ERA0 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tfcp2Q9ERA0 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tfcp2Q9ERA0 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tfcp2Q9ERA0 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tfcp2Q9ERA0 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tfcp2Q9ERA0 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tfcp2Q9ERA0 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tfcp2Q9ERA0 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tfcp2Q9ERA0 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tfcp2Q9ERA0 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tfcp2Q9ERA0 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tfcp2Q9ERA0 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tfcp2Q9ERA0 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tfcp2Q9ERA0 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tfcp2Q9ERA0 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tfcp2Q9ERA0 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tfcp2Q9ERA0 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tfcp2Q9ERA0 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tfcp2Q9ERA0 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tfcp2Q9ERA0 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tfcp2Q9ERA0 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tfcp2Q9ERA0 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tfcp2Q9ERA0 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tfcp2Q9ERA0 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tfcp2Q9ERA0 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tfcp2Q9ERA0 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tfcp2Q9ERA0 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tfcp2Q9ERA0 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tfcp2Q9ERA0 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tfcp2Q9ERA0 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tfcp2Q9ERA0 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tfcp2Q9ERA0 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Tfcp2Q9ERA0 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tfcp2Q9ERA0 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tfcp2Q9ERA0 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tfcp2Q9ERA0 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tfcp2Q9ERA0 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tfcp2Q9ERA0 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tfcp2Q9ERA0 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tfcp2Q9ERA0 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tfcp2Q9ERA0 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Tfcp2Q9ERA0 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tfcp2Q9ERA0 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tfcp2Q9ERA0 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tfcp2Q9ERA0 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tfcp2Q9ERA0 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tfcp2Q9ERA0 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Tfcp2Q9ERA0 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tfcp2Q9ERA0 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tfcp2Q9ERA0 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tfcp2Q9ERA0 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tfcp2Q9ERA0 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tfcp2Q9ERA0 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tfcp2Q9ERA0 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tfcp2Q9ERA0 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Tfcp2Q9ERA0 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tfcp2Q9ERA0 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tfcp2Q9ERA0 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tfcp2Q9ERA0 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tfcp2Q9ERA0 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Tfcp2Q9ERA0 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tfcp2Q9ERA0 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tfcp2Q9ERA0 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tfcp2Q9ERA0 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tfcp2Q9ERA0 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tfcp2Q9ERA0 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tfcp2Q9ERA0 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tfcp2Q9ERA0 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tfcp2Q9ERA0 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tfcp2Q9ERA0 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Tfcp2Q9ERA0 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tfcp2Q9ERA0 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tfcp2Q9ERA0 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tfcp2Q9ERA0 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tfcp2Q9ERA0 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tfcp2Q9ERA0 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tfcp2Q9ERA0 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tfcp2Q9ERA0 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tfcp2Q9ERA0 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tfcp2Q9ERA0 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Tfcp2Q9ERA0 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tfcp2Q9ERA0 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tfcp2Q9ERA0 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tfcp2Q9ERA0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Tfcp2Q9ERA0 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Tfcp2Q9ERA0 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tfcp2Q9ERA0 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tfcp2Q9ERA0 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tfcp2Q9ERA0 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Tfcp2Q9ERA0 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms