Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC26

Slc46a3, Solute carrier family 46 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc46a3Q9DC26 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc46a3Q9DC26 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc46a3Q9DC26 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc46a3Q9DC26 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc46a3Q9DC26 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc46a3Q9DC26 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Slc46a3Q9DC26 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slc46a3Q9DC26 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slc46a3Q9DC26 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slc46a3Q9DC26 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slc46a3Q9DC26 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slc46a3Q9DC26 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slc46a3Q9DC26 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slc46a3Q9DC26 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slc46a3Q9DC26 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slc46a3Q9DC26 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc46a3Q9DC26 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc46a3Q9DC26 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc46a3Q9DC26 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc46a3Q9DC26 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc46a3Q9DC26 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc46a3Q9DC26 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc46a3Q9DC26 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc46a3Q9DC26 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc46a3Q9DC26 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc46a3Q9DC26 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc46a3Q9DC26 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slc46a3Q9DC26 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc46a3Q9DC26 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc46a3Q9DC26 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc46a3Q9DC26 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc46a3Q9DC26 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc46a3Q9DC26 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc46a3Q9DC26 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc46a3Q9DC26 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc46a3Q9DC26 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc46a3Q9DC26 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc46a3Q9DC26 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc46a3Q9DC26 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc46a3Q9DC26 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slc46a3Q9DC26 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Slc46a3Q9DC26 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Slc46a3Q9DC26 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Slc46a3Q9DC26 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Slc46a3Q9DC26 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Slc46a3Q9DC26 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Slc46a3Q9DC26 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc46a3Q9DC26 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc46a3Q9DC26 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc46a3Q9DC26 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc46a3Q9DC26 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slc46a3Q9DC26 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc46a3Q9DC26 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc46a3Q9DC26 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc46a3Q9DC26 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc46a3Q9DC26 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc46a3Q9DC26 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc46a3Q9DC26 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc46a3Q9DC26 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc46a3Q9DC26 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Slc46a3Q9DC26 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc46a3Q9DC26 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc46a3Q9DC26 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc46a3Q9DC26 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc46a3Q9DC26 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc46a3Q9DC26 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc46a3Q9DC26 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc46a3Q9DC26 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc46a3Q9DC26 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc46a3Q9DC26 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc46a3Q9DC26 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc46a3Q9DC26 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc46a3Q9DC26 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc46a3Q9DC26 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc46a3Q9DC26 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc46a3Q9DC26 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc46a3Q9DC26 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc46a3Q9DC26 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc46a3Q9DC26 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc46a3Q9DC26 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc46a3Q9DC26 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc46a3Q9DC26 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Slc46a3Q9DC26 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc46a3Q9DC26 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc46a3Q9DC26 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc46a3Q9DC26 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc46a3Q9DC26 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc46a3Q9DC26 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc46a3Q9DC26 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc46a3Q9DC26 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc46a3Q9DC26 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc46a3Q9DC26 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slc46a3Q9DC26 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc46a3Q9DC26 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc46a3Q9DC26 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc46a3Q9DC26 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc46a3Q9DC26 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc46a3Q9DC26 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc46a3Q9DC26 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slc46a3Q9DC26 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms