Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA80

Rsph3b, Radial spoke head protein 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph3bQ9DA80 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Rsph3bQ9DA80 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rsph3bQ9DA80 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rsph3bQ9DA80 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rsph3bQ9DA80 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rsph3bQ9DA80 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rsph3bQ9DA80 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rsph3bQ9DA80 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rsph3bQ9DA80 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rsph3bQ9DA80 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rsph3bQ9DA80 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rsph3bQ9DA80 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rsph3bQ9DA80 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rsph3bQ9DA80 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Rsph3bQ9DA80 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rsph3bQ9DA80 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Rsph3bQ9DA80 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rsph3bQ9DA80 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rsph3bQ9DA80 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rsph3bQ9DA80 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rsph3bQ9DA80 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rsph3bQ9DA80 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rsph3bQ9DA80 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rsph3bQ9DA80 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rsph3bQ9DA80 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rsph3bQ9DA80 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rsph3bQ9DA80 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rsph3bQ9DA80 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rsph3bQ9DA80 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rsph3bQ9DA80 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rsph3bQ9DA80 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rsph3bQ9DA80 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rsph3bQ9DA80 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rsph3bQ9DA80 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rsph3bQ9DA80 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rsph3bQ9DA80 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rsph3bQ9DA80 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rsph3bQ9DA80 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rsph3bQ9DA80 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rsph3bQ9DA80 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rsph3bQ9DA80 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rsph3bQ9DA80 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rsph3bQ9DA80 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rsph3bQ9DA80 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rsph3bQ9DA80 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rsph3bQ9DA80 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rsph3bQ9DA80 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rsph3bQ9DA80 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rsph3bQ9DA80 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rsph3bQ9DA80 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rsph3bQ9DA80 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rsph3bQ9DA80 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rsph3bQ9DA80 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rsph3bQ9DA80 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rsph3bQ9DA80 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rsph3bQ9DA80 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rsph3bQ9DA80 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rsph3bQ9DA80 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rsph3bQ9DA80 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rsph3bQ9DA80 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rsph3bQ9DA80 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rsph3bQ9DA80 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rsph3bQ9DA80 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rsph3bQ9DA80 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Rsph3bQ9DA80 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rsph3bQ9DA80 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rsph3bQ9DA80 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rsph3bQ9DA80 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rsph3bQ9DA80 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Rsph3bQ9DA80 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rsph3bQ9DA80 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rsph3bQ9DA80 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rsph3bQ9DA80 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rsph3bQ9DA80 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rsph3bQ9DA80 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rsph3bQ9DA80 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rsph3bQ9DA80 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rsph3bQ9DA80 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rsph3bQ9DA80 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Rsph3bQ9DA80 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rsph3bQ9DA80 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rsph3bQ9DA80 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rsph3bQ9DA80 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rsph3bQ9DA80 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rsph3bQ9DA80 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rsph3bQ9DA80 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rsph3bQ9DA80 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rsph3bQ9DA80 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rsph3bQ9DA80 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rsph3bQ9DA80 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rsph3bQ9DA80 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rsph3bQ9DA80 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rsph3bQ9DA80 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rsph3bQ9DA80 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rsph3bQ9DA80 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rsph3bQ9DA80 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rsph3bQ9DA80 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rsph3bQ9DA80 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rsph3bQ9DA80 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rsph3bQ9DA80 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.7 ms