Protein–RNA interactions for Protein: Q9D816

Cyp2c55, Cytochrome P450 2C55, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp2c55Q9D816 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cyp2c55Q9D816 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cyp2c55Q9D816 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cyp2c55Q9D816 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cyp2c55Q9D816 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cyp2c55Q9D816 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cyp2c55Q9D816 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cyp2c55Q9D816 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cyp2c55Q9D816 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cyp2c55Q9D816 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Cyp2c55Q9D816 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Cyp2c55Q9D816 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cyp2c55Q9D816 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cyp2c55Q9D816 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cyp2c55Q9D816 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cyp2c55Q9D816 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cyp2c55Q9D816 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cyp2c55Q9D816 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cyp2c55Q9D816 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cyp2c55Q9D816 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cyp2c55Q9D816 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cyp2c55Q9D816 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cyp2c55Q9D816 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cyp2c55Q9D816 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cyp2c55Q9D816 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cyp2c55Q9D816 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cyp2c55Q9D816 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cyp2c55Q9D816 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cyp2c55Q9D816 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cyp2c55Q9D816 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cyp2c55Q9D816 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cyp2c55Q9D816 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cyp2c55Q9D816 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cyp2c55Q9D816 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cyp2c55Q9D816 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cyp2c55Q9D816 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cyp2c55Q9D816 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cyp2c55Q9D816 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cyp2c55Q9D816 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cyp2c55Q9D816 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cyp2c55Q9D816 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cyp2c55Q9D816 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cyp2c55Q9D816 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cyp2c55Q9D816 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cyp2c55Q9D816 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Cyp2c55Q9D816 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cyp2c55Q9D816 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cyp2c55Q9D816 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cyp2c55Q9D816 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cyp2c55Q9D816 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cyp2c55Q9D816 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cyp2c55Q9D816 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cyp2c55Q9D816 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cyp2c55Q9D816 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cyp2c55Q9D816 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cyp2c55Q9D816 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Cyp2c55Q9D816 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cyp2c55Q9D816 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cyp2c55Q9D816 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cyp2c55Q9D816 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cyp2c55Q9D816 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cyp2c55Q9D816 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cyp2c55Q9D816 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Cyp2c55Q9D816 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cyp2c55Q9D816 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cyp2c55Q9D816 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cyp2c55Q9D816 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cyp2c55Q9D816 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Cyp2c55Q9D816 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cyp2c55Q9D816 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cyp2c55Q9D816 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cyp2c55Q9D816 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Cyp2c55Q9D816 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cyp2c55Q9D816 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cyp2c55Q9D816 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cyp2c55Q9D816 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cyp2c55Q9D816 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cyp2c55Q9D816 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cyp2c55Q9D816 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cyp2c55Q9D816 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Cyp2c55Q9D816 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Cyp2c55Q9D816 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cyp2c55Q9D816 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cyp2c55Q9D816 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cyp2c55Q9D816 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cyp2c55Q9D816 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cyp2c55Q9D816 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cyp2c55Q9D816 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cyp2c55Q9D816 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cyp2c55Q9D816 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cyp2c55Q9D816 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cyp2c55Q9D816 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cyp2c55Q9D816 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cyp2c55Q9D816 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cyp2c55Q9D816 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cyp2c55Q9D816 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cyp2c55Q9D816 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cyp2c55Q9D816 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cyp2c55Q9D816 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cyp2c55Q9D816 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms