Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4K7

Ccdc105, Coiled-coil domain-containing protein 105, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc105Q9D4K7 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc105Q9D4K7 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc105Q9D4K7 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc105Q9D4K7 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc105Q9D4K7 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc105Q9D4K7 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc105Q9D4K7 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc105Q9D4K7 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc105Q9D4K7 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc105Q9D4K7 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc105Q9D4K7 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc105Q9D4K7 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc105Q9D4K7 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc105Q9D4K7 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc105Q9D4K7 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc105Q9D4K7 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc105Q9D4K7 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc105Q9D4K7 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc105Q9D4K7 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc105Q9D4K7 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc105Q9D4K7 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc105Q9D4K7 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc105Q9D4K7 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc105Q9D4K7 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc105Q9D4K7 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc105Q9D4K7 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc105Q9D4K7 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc105Q9D4K7 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc105Q9D4K7 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc105Q9D4K7 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc105Q9D4K7 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc105Q9D4K7 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc105Q9D4K7 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc105Q9D4K7 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc105Q9D4K7 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc105Q9D4K7 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc105Q9D4K7 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc105Q9D4K7 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc105Q9D4K7 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc105Q9D4K7 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc105Q9D4K7 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc105Q9D4K7 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc105Q9D4K7 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc105Q9D4K7 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc105Q9D4K7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc105Q9D4K7 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc105Q9D4K7 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc105Q9D4K7 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc105Q9D4K7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc105Q9D4K7 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc105Q9D4K7 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc105Q9D4K7 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc105Q9D4K7 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc105Q9D4K7 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc105Q9D4K7 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc105Q9D4K7 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc105Q9D4K7 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc105Q9D4K7 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc105Q9D4K7 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc105Q9D4K7 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc105Q9D4K7 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc105Q9D4K7 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc105Q9D4K7 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc105Q9D4K7 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc105Q9D4K7 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc105Q9D4K7 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc105Q9D4K7 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc105Q9D4K7 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc105Q9D4K7 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc105Q9D4K7 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc105Q9D4K7 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc105Q9D4K7 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc105Q9D4K7 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc105Q9D4K7 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc105Q9D4K7 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc105Q9D4K7 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc105Q9D4K7 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc105Q9D4K7 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc105Q9D4K7 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc105Q9D4K7 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc105Q9D4K7 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc105Q9D4K7 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc105Q9D4K7 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc105Q9D4K7 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc105Q9D4K7 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc105Q9D4K7 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc105Q9D4K7 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc105Q9D4K7 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc105Q9D4K7 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc105Q9D4K7 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc105Q9D4K7 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc105Q9D4K7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc105Q9D4K7 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc105Q9D4K7 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc105Q9D4K7 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc105Q9D4K7 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc105Q9D4K7 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc105Q9D4K7 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc105Q9D4K7 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc105Q9D4K7 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms