Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J9

4931423N10Rik, MCG52616, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931423N10RikQ9D4J9 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
4931423N10RikQ9D4J9 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
4931423N10RikQ9D4J9 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
4931423N10RikQ9D4J9 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
4931423N10RikQ9D4J9 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
4931423N10RikQ9D4J9 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
4931423N10RikQ9D4J9 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
4931423N10RikQ9D4J9 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
4931423N10RikQ9D4J9 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
4931423N10RikQ9D4J9 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
4931423N10RikQ9D4J9 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
4931423N10RikQ9D4J9 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
4931423N10RikQ9D4J9 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
4931423N10RikQ9D4J9 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
4931423N10RikQ9D4J9 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
4931423N10RikQ9D4J9 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
4931423N10RikQ9D4J9 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4931423N10RikQ9D4J9 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
4931423N10RikQ9D4J9 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
4931423N10RikQ9D4J9 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
4931423N10RikQ9D4J9 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
4931423N10RikQ9D4J9 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
4931423N10RikQ9D4J9 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
4931423N10RikQ9D4J9 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
4931423N10RikQ9D4J9 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
4931423N10RikQ9D4J9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
4931423N10RikQ9D4J9 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
4931423N10RikQ9D4J9 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
4931423N10RikQ9D4J9 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
4931423N10RikQ9D4J9 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
4931423N10RikQ9D4J9 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
4931423N10RikQ9D4J9 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
4931423N10RikQ9D4J9 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
4931423N10RikQ9D4J9 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
4931423N10RikQ9D4J9 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
4931423N10RikQ9D4J9 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
4931423N10RikQ9D4J9 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
4931423N10RikQ9D4J9 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
4931423N10RikQ9D4J9 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
4931423N10RikQ9D4J9 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
4931423N10RikQ9D4J9 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
4931423N10RikQ9D4J9 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
4931423N10RikQ9D4J9 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
4931423N10RikQ9D4J9 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
4931423N10RikQ9D4J9 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
4931423N10RikQ9D4J9 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
4931423N10RikQ9D4J9 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
4931423N10RikQ9D4J9 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
4931423N10RikQ9D4J9 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
4931423N10RikQ9D4J9 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
4931423N10RikQ9D4J9 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
4931423N10RikQ9D4J9 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
4931423N10RikQ9D4J9 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
4931423N10RikQ9D4J9 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
4931423N10RikQ9D4J9 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
4931423N10RikQ9D4J9 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
4931423N10RikQ9D4J9 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
4931423N10RikQ9D4J9 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
4931423N10RikQ9D4J9 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4931423N10RikQ9D4J9 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4931423N10RikQ9D4J9 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4931423N10RikQ9D4J9 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4931423N10RikQ9D4J9 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4931423N10RikQ9D4J9 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4931423N10RikQ9D4J9 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4931423N10RikQ9D4J9 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4931423N10RikQ9D4J9 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4931423N10RikQ9D4J9 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
4931423N10RikQ9D4J9 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
4931423N10RikQ9D4J9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4931423N10RikQ9D4J9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
4931423N10RikQ9D4J9 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
4931423N10RikQ9D4J9 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4931423N10RikQ9D4J9 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4931423N10RikQ9D4J9 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
4931423N10RikQ9D4J9 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
4931423N10RikQ9D4J9 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4931423N10RikQ9D4J9 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4931423N10RikQ9D4J9 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
4931423N10RikQ9D4J9 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4931423N10RikQ9D4J9 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4931423N10RikQ9D4J9 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4931423N10RikQ9D4J9 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4931423N10RikQ9D4J9 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
4931423N10RikQ9D4J9 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4931423N10RikQ9D4J9 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4931423N10RikQ9D4J9 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4931423N10RikQ9D4J9 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
4931423N10RikQ9D4J9 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
4931423N10RikQ9D4J9 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4931423N10RikQ9D4J9 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4931423N10RikQ9D4J9 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4931423N10RikQ9D4J9 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4931423N10RikQ9D4J9 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
4931423N10RikQ9D4J9 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
4931423N10RikQ9D4J9 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
4931423N10RikQ9D4J9 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
4931423N10RikQ9D4J9 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
4931423N10RikQ9D4J9 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
4931423N10RikQ9D4J9 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms